More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4327 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4327  histidine kinase A domain-containing protein  100 
 
 		 415 aa  849    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4622  sensor histidine kinase  83.33 
 
 		 413 aa  701    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3797  ATPase domain-containing protein  85.3 
 
 		 413 aa  725    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4006  histidine kinase A domain-containing protein  82.08 
 
 		 413 aa  669    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4195  histidine kinase A domain-containing protein  98.31 
 
 		 415 aa  836    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0692  histidine kinase A domain-containing protein  54.88 
 
 		 404 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3576  histidine kinase A domain-containing protein  53.27 
 
 		 406 aa  448  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2297  Signal transduction histidine kinase-like  23.55 
 
 		 446 aa  96.3  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247505  hitchhiker  0.000082991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2810  histidine kinase  29.41 
 
 		 425 aa  96.3  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4638  sensor histidine kinase  30.04 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1973  histidine kinase  29.49 
 
 		 422 aa  94.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.73664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2061  putative two-component sensor  28.94 
 
 		 431 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2252  histidine kinase  25.42 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24340  putative two-component sensor  31.67 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  24.73 
 
 		 435 aa  82.8  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  25.07 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02793  histidine kinase  25.97 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04467  two-component system (histidine kinase) sensor protein requried for AvrXa21 activity H (raxH)  29.52 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001594  two-component system sensor protein  24.53 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000479105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0334  histidine kinase  27.36 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000559138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  27.37 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  23.3 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1866  sensor histidine kinase  24.53 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.18 
 
 		 421 aa  76.3  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  24.48 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05571  sensory transduction protein kinase  27.23 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353371 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003061  two-component system sensor protein  24.86 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.45 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3439  Signal transduction histidine kinase-like  24.2 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000017519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2642  sensor histidine kinase  28 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.244154  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.63 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17790  sensory histidine protein kinase, two-component, ColS  26.05 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  24.94 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.671224  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3157  histidine kinase  22.32 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0417  putative sensor kinase protein  26.73 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3631  histidine kinase  23.91 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2374  sensor histidine kinase  26.91 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171494  normal  0.151024 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  24.6 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  26.39 
 
 		 573 aa  63.9  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  23.75 
 
 		 500 aa  63.5  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  27.27 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  26.39 
 
 		 573 aa  63.5  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 445 aa  63.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 500 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0988  sensor histidine kinase ArlS  25.88 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101467  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2665  histidine kinase  26.58 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3010  histidine kinase A domain-containing protein  25.09 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.728657  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 449 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2585  histidine kinase  25.4 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  decreased coverage  0.00983118 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  25.68 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 572 aa  62  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4951  putative two-component sensor  24.78 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.56 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  25.36 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2876  putative sensor histidine kinase SrrB  27.03 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  25.36 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  25.36 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  25.36 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  25.36 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  25.18 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  25.36 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  25.36 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1450  histidine kinase  26.23 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56940  putative two-component sensor  24.78 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1870  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181656  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1282  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 548 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.153514  normal  0.0403413 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6737  histidine kinase  22.9 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  0.372172 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  25 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  24.73 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4962  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  23.87 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2214  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.46 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.55 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1042  phosphate regulon sensor protein  23.91 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4932  histidine kinase  25.28 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2892  sensor histidine kinase SrrB, putative  23.02 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000807575  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  25 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2130  histidine kinase  25.65 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003618  signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4069  sensor histidine kinase  24.51 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00769633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  22.83 
 
 		 608 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  24.09 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>