More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3157 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3157  histidine kinase  100 
 
 		 407 aa  842    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0466  histidine kinase  59.61 
 
 		 422 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2539  histidine kinase A domain protein  35.24 
 
 		 417 aa  242  7.999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2731  twp-component sensor histidine kinase  33.98 
 
 		 422 aa  231  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2585  histidine kinase  34.18 
 
 		 444 aa  196  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  decreased coverage  0.00983118 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6963  histidine kinase  32.56 
 
 		 432 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.20821  normal  0.0498309 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1333  histidine kinase A domain protein  34.93 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1450  histidine kinase  29.03 
 
 		 424 aa  189  5.999999999999999e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4554  histidine kinase  32.62 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00930403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6737  histidine kinase  29.92 
 
 		 421 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  0.372172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4932  histidine kinase  33.66 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0719  sensor histidine kinase  29.76 
 
 		 427 aa  156  8e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.420092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4883  histidine kinase  34.31 
 
 		 347 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.876275 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3533  two-component sensor histidine kinase  30.34 
 
 		 419 aa  150  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1621  histidine kinase  28.42 
 
 		 421 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1184  ATP-binding region ATPase domain protein  27.8 
 
 		 436 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2455  ATP-binding region ATPase domain protein  27.68 
 
 		 438 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0530823  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 		 478 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  30.09 
 
 		 478 aa  97.4  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  28.1 
 
 		 343 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 513 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 454 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 498 aa  94  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 375 aa  94.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.960828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 534 aa  94  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  32.02 
 
 		 460 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 404 aa  92.8  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  29.73 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  28.68 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000024219  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  27.09 
 
 		 413 aa  90.9  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  31.62 
 
 		 460 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  28.29 
 
 		 389 aa  89.7  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 459 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1357  sensor histidine kinase  25.74 
 
 		 396 aa  89.7  9e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.27 
 
 		 466 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4962  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 448 aa  87.4  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  27.27 
 
 		 344 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 463 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 		 455 aa  87  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  30.43 
 
 		 467 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5789  histidine kinase  31.02 
 
 		 405 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 490 aa  86.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1478  histidine kinase  27.04 
 
 		 270 aa  86.7  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000106668  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  33.18 
 
 		 347 aa  86.3  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 459 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1235  sensor histidine kinase  25.32 
 
 		 353 aa  86.3  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000222357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 469 aa  86.3  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  22.54 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  30.67 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 448 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  24.65 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  25 
 
 		 583 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  27.92 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5393  two-component signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  25.98 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  27.57 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  31.44 
 
 		 466 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4755  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.39 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18050  signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  30 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 451 aa  83.2  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.64 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1425  histidine kinase  32.9 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  25.38 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  29.15 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.75 
 
 		 466 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4099  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 465 aa  82.8  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 455 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  30.93 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  32.7 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  33.33 
 
 		 376 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  25.49 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  31 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  31 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0081  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  24.29 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  26.95 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  31 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  31 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  24.52 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  24.29 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  24.29 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  24.29 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 465 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  24.29 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  28.37 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2267  histidine kinase  28.35 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.643176  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  27.16 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  30.13 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>