More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1333 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1333  histidine kinase A domain protein  100 
 
 		 412 aa  839    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3157  histidine kinase  34.93 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2539  histidine kinase A domain protein  29.76 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2585  histidine kinase  35.49 
 
 		 444 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  decreased coverage  0.00983118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0466  histidine kinase  31.37 
 
 		 422 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2731  twp-component sensor histidine kinase  29.29 
 
 		 422 aa  177  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4883  histidine kinase  37.73 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.876275 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6737  histidine kinase  29.44 
 
 		 421 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  0.372172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4554  histidine kinase  29.07 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00930403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6963  histidine kinase  34.04 
 
 		 432 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.20821  normal  0.0498309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4932  histidine kinase  26.37 
 
 		 426 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1450  histidine kinase  30.97 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3533  two-component sensor histidine kinase  34.18 
 
 		 419 aa  126  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_002950  PG0719  sensor histidine kinase  29.82 
 
 		 427 aa  120  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.420092 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0127  two-component sensor histidine kinase  34.16 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.202899  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1279  sensor histidine kinase  30.65 
 
 		 388 aa  93.6  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00018737  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2455  ATP-binding region ATPase domain protein  27.41 
 
 		 438 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0530823  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0354974  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5169  sensor histidine kinase  26.06 
 
 		 451 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01883  predicted sensory kinase in two-component regulatory system with YedW  24.05 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000273191  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01873  hypothetical protein  24.05 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000189435  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1683  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.05 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103684  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2747  heavy metal sensor histidine kinase  27.23 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000765675  normal  0.226821 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  25.23 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  24.42 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1677  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00542699  normal  0.137628 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2199  heavy metal sensor histidine kinase  24.22 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573761  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2069  heavy metal sensor histidine kinase  24.22 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260853  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0137  sensor histidine kinase  28.44 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1621  histidine kinase  27.6 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0915  heavy metal sensor histidine kinase  24.22 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000246705  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  26.55 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1357  sensor histidine kinase  28.35 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  27.82 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1235  sensor histidine kinase  28.35 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000222357  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0256  sensor histidine kinase  27.33 
 
 		 615 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1217  heavy metal sensor histidine kinase  24.22 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00057319  normal  0.58155 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1963  sensor histidine kinase  30.19 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553892  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1926  histidine kinase  27.43 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  28.03 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1753  histidine kinase  24.83 
 
 		 578 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131886  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1009  phosphate regulon sensor protein  28.08 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1159  heavy metal sensor kinase subfamily  27.97 
 
 		 454 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.433807 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  23.55 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  27.31 
 
 		 491 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1054  heavy metal sensor kinase subfamily  27.97 
 
 		 454 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1170  heavy metal sensor kinase family protein  27.97 
 
 		 454 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  27.31 
 
 		 491 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3301  phosphate regulon sensor protein  28.08 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  25.44 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  23.27 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2810  histidine kinase  28.65 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1190  heavy metal sensor kinase subfamily  27.97 
 
 		 454 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  23.34 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  28.06 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1492  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 624 aa  75.1  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.411872  decreased coverage  0.00494446 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  24.35 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1325  hypothetical protein  26.79 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.219372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  26.48 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  27.31 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2073  sensor histidine kinase  27.49 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  23.85 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  23.85 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0489  sensor histidine kinase  27.49 
 
 		 722 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  23.85 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  30.19 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1205  heavy metal sensor kinase subfamily  27.97 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1976  sensor histidine kinase  27.49 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  23.85 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  28.52 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  23.85 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  23.85 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  23.85 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  26.78 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0784  histidine kinase  27.03 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0431535  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5393  two-component signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983917  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  25.85 
 
 		 482 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  25.15 
 
 		 475 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 		 513 aa  73.6  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  24.45 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  21.99 
 
 		 498 aa  73.6  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0904  sensor histidine kinase  29.09 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616336  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.97 
 
 		 830 aa  73.2  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  25.29 
 
 		 482 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  28.64 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3145  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 439 aa  72.8  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187878  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3178  sensory box histidine kinase VicK, putative  27.04 
 
 		 615 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111783  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  25.53 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  29.44 
 
 		 471 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  29.44 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.09 
 
 		 480 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.53 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2038  ATP-binding region ATPase domain protein  25.75 
 
 		 473 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>