More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5393 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5169  sensor histidine kinase  77.38 
 
 		 451 aa  651    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5393  two-component signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 450 aa  890    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0904  sensor histidine kinase  68.9 
 
 		 454 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616336  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2073  sensor histidine kinase  69.14 
 
 		 453 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0558  sensor histidine kinase  68.92 
 
 		 453 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0785  sensor histidine kinase  68.92 
 
 		 453 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.190623  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1623  sensor histidine kinase  68.92 
 
 		 453 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0670  sensor histidine kinase  68.92 
 
 		 453 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539179  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0489  sensor histidine kinase  69.14 
 
 		 722 aa  564  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620999  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1976  sensor histidine kinase  68.92 
 
 		 453 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3283  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.33 
 
 		 456 aa  378  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0209  sensor histidine kinase  48.27 
 
 		 446 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  48.27 
 
 		 446 aa  375  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.99 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0460995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.99 
 
 		 441 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0024043  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4962  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.96 
 
 		 448 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3975  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.66 
 
 		 438 aa  338  8e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.67 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3095  histidine kinase  47.95 
 
 		 457 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.12 
 
 		 451 aa  329  7e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 		 445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.92 
 
 		 456 aa  300  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6258  two component sensor kinase  39.86 
 
 		 440 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0553015  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 450 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.19 
 
 		 438 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.19 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.823775  normal  0.178217 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 461 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 449 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3286  histidine kinase  32.43 
 
 		 450 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00148382  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3444  histidine kinase  33.02 
 
 		 464 aa  150  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3149  sensor histidine kinase  34.9 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.28591  hitchhiker  0.000661771 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1464  histidine kinase  30.68 
 
 		 469 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.173941  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  28.97 
 
 		 438 aa  140  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  28.69 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  28.69 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  29.36 
 
 		 438 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  29.36 
 
 		 438 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  29.36 
 
 		 438 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  29.36 
 
 		 438 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  29.36 
 
 		 438 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 458 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2595  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 437 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 433 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 445 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  29.98 
 
 		 519 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  29.52 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 438 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 466 aa  130  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 453 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 455 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 455 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.42 
 
 		 450 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 448 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 461 aa  127  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.33 
 
 		 443 aa  126  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  28.89 
 
 		 442 aa  126  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.42 
 
 		 450 aa  126  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  28.95 
 
 		 459 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  31.85 
 
 		 444 aa  126  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  31.21 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  31.21 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  31.21 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  31.21 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  29.46 
 
 		 449 aa  124  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3457  putative signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.805731  normal  0.295467 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 446 aa  123  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 451 aa  123  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.536058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1753  histidine kinase  30.7 
 
 		 451 aa  123  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  31.72 
 
 		 467 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0693  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 		 487 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  31.21 
 
 		 1093 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0125  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0421257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  27.6 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.93 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 446 aa  119  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  31.14 
 
 		 449 aa  119  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  33.1 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1144  histidine kinase  29.07 
 
 		 475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2077  signal transduction histidine kinase sensor  25.58 
 
 		 487 aa  117  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  28.13 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 439 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  32.5 
 
 		 438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  28.41 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  28.81 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  30.1 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 443 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>