More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0489 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0670  sensor histidine kinase  99.56 
 
 
453 aa  867    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539179  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0785  sensor histidine kinase  99.56 
 
 
453 aa  867    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.190623  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0558  sensor histidine kinase  99.56 
 
 
453 aa  867    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1976  sensor histidine kinase  99.56 
 
 
453 aa  870    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0489  sensor histidine kinase  100 
 
 
722 aa  1376    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620999  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2073  sensor histidine kinase  100 
 
 
453 aa  873    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1623  sensor histidine kinase  99.56 
 
 
453 aa  867    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0904  sensor histidine kinase  90.85 
 
 
454 aa  748    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616336  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5169  sensor histidine kinase  71.68 
 
 
451 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5393  two-component signal transduction histidine kinase  68.92 
 
 
450 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983917  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  51.03 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0209  sensor histidine kinase  51.03 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.47 
 
 
426 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3283  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.42 
 
 
456 aa  364  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.08 
 
 
441 aa  362  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0024043  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3975  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.34 
 
 
438 aa  362  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.242416  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.77 
 
 
441 aa  361  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0460995  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4962  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
448 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480861  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3095  histidine kinase  48.29 
 
 
457 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.12 
 
 
451 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 
445 aa  310  5.9999999999999995e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127602  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.57 
 
 
456 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.98 
 
 
438 aa  283  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.53 
 
 
438 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.823775  normal  0.178217 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6258  two component sensor kinase  40.63 
 
 
440 aa  273  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0553015  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 
450 aa  247  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
461 aa  201  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
449 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3286  histidine kinase  33.11 
 
 
450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00148382  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3444  histidine kinase  34.29 
 
 
464 aa  162  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3149  sensor histidine kinase  38.11 
 
 
440 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.28591  hitchhiker  0.000661771 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1464  histidine kinase  32.6 
 
 
469 aa  154  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.173941  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
445 aa  150  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
453 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
445 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  31.77 
 
 
438 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
448 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  31.75 
 
 
438 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  31.75 
 
 
438 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  31.75 
 
 
438 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  31.75 
 
 
438 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  31.75 
 
 
438 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  31.77 
 
 
438 aa  147  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  31.77 
 
 
438 aa  147  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  37.67 
 
 
443 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
450 aa  145  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  31.77 
 
 
1093 aa  145  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
454 aa  144  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0125  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
438 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0421257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2595  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
441 aa  140  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  30.6 
 
 
442 aa  138  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  33.26 
 
 
444 aa  138  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
444 aa  137  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
438 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  32.01 
 
 
455 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1753  histidine kinase  32.41 
 
 
451 aa  137  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
451 aa  136  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.536058 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
461 aa  135  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
458 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
458 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
450 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
433 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1144  histidine kinase  29.92 
 
 
475 aa  130  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931606  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
449 aa  130  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  31.66 
 
 
467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  30.31 
 
 
519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  33.52 
 
 
459 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
438 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  35.16 
 
 
459 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  35.16 
 
 
459 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
456 aa  128  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  35.16 
 
 
459 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  31.69 
 
 
448 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
448 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
448 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  35.16 
 
 
459 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
463 aa  127  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
463 aa  127  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  31.58 
 
 
449 aa  127  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
437 aa  126  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
476 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  31.17 
 
 
463 aa  126  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
458 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.18 
 
 
433 aa  125  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
467 aa  125  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  30.11 
 
 
459 aa  125  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
466 aa  124  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
478 aa  124  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
461 aa  124  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  30.77 
 
 
474 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  35.34 
 
 
438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
474 aa  122  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
474 aa  122  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  34.3 
 
 
449 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
450 aa  121  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>