More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3283 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3283  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 456 aa  897    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3975  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  58.49 
 
 		 438 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0209  sensor histidine kinase  49.19 
 
 		 446 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  49.19 
 
 		 446 aa  403  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0904  sensor histidine kinase  48.3 
 
 		 454 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616336  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5169  sensor histidine kinase  47.95 
 
 		 451 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.23 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5393  two-component signal transduction histidine kinase  48.11 
 
 		 450 aa  363  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0558  sensor histidine kinase  48.64 
 
 		 453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0785  sensor histidine kinase  48.64 
 
 		 453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.190623  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0670  sensor histidine kinase  48.64 
 
 		 453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539179  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1623  sensor histidine kinase  48.64 
 
 		 453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1976  sensor histidine kinase  48.64 
 
 		 453 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4962  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 		 448 aa  355  6.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 		 441 aa  355  6.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0024043  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2073  sensor histidine kinase  48.41 
 
 		 453 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0489  sensor histidine kinase  48.19 
 
 		 722 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.66 
 
 		 441 aa  353  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0460995  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3095  histidine kinase  46.67 
 
 		 457 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.79 
 
 		 451 aa  327  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.44 
 
 		 456 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6258  two component sensor kinase  39.19 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0553015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 445 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 		 438 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 438 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.823775  normal  0.178217 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 450 aa  216  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 461 aa  204  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1464  histidine kinase  34.48 
 
 		 469 aa  164  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.173941  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3444  histidine kinase  35.27 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3286  histidine kinase  32.74 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00148382  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2595  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3149  sensor histidine kinase  36.98 
 
 		 440 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.28591  hitchhiker  0.000661771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 450 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 450 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  31.82 
 
 		 454 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  32.7 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  31.46 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  31.46 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  31.46 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  31.46 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  31.46 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  31.31 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  31.31 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2077  signal transduction histidine kinase sensor  28.48 
 
 		 487 aa  143  7e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1753  histidine kinase  32.36 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  31.24 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.536058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1144  histidine kinase  31.4 
 
 		 475 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4905  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 445 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  30.28 
 
 		 441 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 445 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0671  sensor protein QseC  29.49 
 
 		 449 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 445 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02898  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with QseB  29.49 
 
 		 449 aa  136  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.760394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0674  histidine kinase  29.49 
 
 		 449 aa  136  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02848  hypothetical protein  29.49 
 
 		 449 aa  136  9e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3204  sensor protein QseC  29.49 
 
 		 449 aa  136  9e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4241  sensor protein QseC  26.2 
 
 		 449 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0693  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 487 aa  134  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3681  hypothetical protein  30.36 
 
 		 455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.740643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  30.92 
 
 		 446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  36.04 
 
 		 455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 461 aa  133  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 455 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 455 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  31.5 
 
 		 446 aa  132  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  34.65 
 
 		 501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3460  sensor protein QseC  29.27 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  30.41 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3491  sensor protein QseC  29.27 
 
 		 449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0135  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 455 aa  131  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0665221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3315  sensor protein QseC  29.05 
 
 		 449 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0769555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0125  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 438 aa  131  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0421257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  29.23 
 
 		 452 aa  130  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4335  sensor protein QseC  28.82 
 
 		 449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  29.43 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  30.77 
 
 		 519 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 456 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  32.49 
 
 		 444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3472  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 445 aa  127  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 437 aa  126  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 		 452 aa  126  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166082  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  31.78 
 
 		 471 aa  126  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 515 aa  126  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  31.87 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 515 aa  126  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>