More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1144 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1144  histidine kinase  100 
 
 		 475 aa  941    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3286  histidine kinase  46.12 
 
 		 450 aa  360  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00148382  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1753  histidine kinase  45.8 
 
 		 451 aa  320  5e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.8 
 
 		 451 aa  320  5e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.536058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1464  histidine kinase  43.29 
 
 		 469 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.173941  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 449 aa  183  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 441 aa  177  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0460995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 441 aa  176  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0024043  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 426 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3975  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5169  sensor histidine kinase  32.19 
 
 		 451 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3095  histidine kinase  30.29 
 
 		 457 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4962  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 448 aa  154  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3283  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 456 aa  151  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3149  sensor histidine kinase  34.19 
 
 		 440 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.28591  hitchhiker  0.000661771 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  29.36 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0209  sensor histidine kinase  29.36 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6258  two component sensor kinase  27.51 
 
 		 440 aa  144  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0553015  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0904  sensor histidine kinase  30.72 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616336  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3444  histidine kinase  32.69 
 
 		 464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0670  sensor histidine kinase  31.84 
 
 		 453 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539179  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0785  sensor histidine kinase  31.84 
 
 		 453 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.190623  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1623  sensor histidine kinase  31.84 
 
 		 453 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0558  sensor histidine kinase  31.84 
 
 		 453 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.823775  normal  0.178217 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2073  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0489  sensor histidine kinase  32.11 
 
 		 722 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620999  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1976  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  28.54 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  28.29 
 
 		 471 aa  134  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5393  two-component signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 451 aa  130  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  27.71 
 
 		 478 aa  126  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  27.71 
 
 		 478 aa  126  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  33.09 
 
 		 444 aa  123  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2595  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  29.72 
 
 		 449 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 466 aa  121  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  33.96 
 
 		 438 aa  115  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 438 aa  115  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 458 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3275  histidine kinase  34.04 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443342 
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  32.25 
 
 		 438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  28.7 
 
 		 455 aa  110  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.66 
 
 		 513 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 461 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3145  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 433 aa  107  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4830  two-component regulatory system sensory histidine kinase  28.87 
 
 		 457 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00276208  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 455 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3742  sensor protein BasS/PmrB  32.17 
 
 		 355 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3608  sensor protein BasS/PmrB  32.17 
 
 		 355 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000312076  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0023  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3880  histidine kinase  32.34 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3915  sensor protein BasS/PmrB  32.34 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  29.1 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1828  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0770919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  30.88 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0050  histidine kinase  32.64 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  30.88 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  30.88 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  30.88 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  28.74 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4686  sensor protein BasS/PmrB  32.2 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4546  sensor protein BasS/PmrB  32.2 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  32.04 
 
 		 455 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  30.88 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4553  sensor protein BasS/PmrB  32.2 
 
 		 349 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4637  sensor protein BasS/PmrB  32.2 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1886  ATPase domain-containing protein  25.92 
 
 		 464 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4637  sensor protein BasS/PmrB  32.2 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 		 466 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00327402  normal  0.336975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BasR  32.01 
 
 		 363 aa  103  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03944  hypothetical protein  32.01 
 
 		 363 aa  103  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 450 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  27.07 
 
 		 438 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  27.07 
 
 		 438 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  27.07 
 
 		 438 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  27.07 
 
 		 438 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  27.07 
 
 		 438 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  27.07 
 
 		 438 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  27.07 
 
 		 438 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 455 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 455 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4577  sensor protein BasS/PmrB  32.01 
 
 		 366 aa  103  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>