More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2155 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
449 aa  913    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.67 
 
 
461 aa  466  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
450 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3283  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
456 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5169  sensor histidine kinase  34.15 
 
 
451 aa  213  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3095  histidine kinase  34.1 
 
 
457 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4962  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
448 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480861  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1976  sensor histidine kinase  33.98 
 
 
453 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1623  sensor histidine kinase  33.98 
 
 
453 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0670  sensor histidine kinase  33.98 
 
 
453 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539179  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0558  sensor histidine kinase  33.98 
 
 
453 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0785  sensor histidine kinase  33.98 
 
 
453 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.190623  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2073  sensor histidine kinase  33.74 
 
 
453 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0904  sensor histidine kinase  32.96 
 
 
454 aa  205  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616336  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6258  two component sensor kinase  33.94 
 
 
440 aa  203  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0553015  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0489  sensor histidine kinase  33.74 
 
 
722 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0024043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
441 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0460995  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3975  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 
438 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.242416  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  32.37 
 
 
446 aa  196  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0209  sensor histidine kinase  32.37 
 
 
446 aa  196  7e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5393  two-component signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
450 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983917  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
456 aa  194  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
445 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127602  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
438 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.823775  normal  0.178217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1464  histidine kinase  29.87 
 
 
469 aa  179  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.173941  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1753  histidine kinase  32.29 
 
 
451 aa  178  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
451 aa  177  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.536058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1144  histidine kinase  28.33 
 
 
475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931606  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3286  histidine kinase  30.45 
 
 
450 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00148382  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3149  sensor histidine kinase  32.02 
 
 
440 aa  152  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.28591  hitchhiker  0.000661771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3444  histidine kinase  27.48 
 
 
464 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 
437 aa  127  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
453 aa  123  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  28.35 
 
 
442 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 
466 aa  121  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  29.21 
 
 
454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  27.82 
 
 
449 aa  120  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  26.4 
 
 
519 aa  119  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  26.3 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0135  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0665221  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  25.23 
 
 
459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  28.97 
 
 
438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  27.95 
 
 
459 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  27.95 
 
 
459 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  27.95 
 
 
459 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  27.95 
 
 
459 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  27.95 
 
 
459 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  28.41 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  26.29 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  28.41 
 
 
438 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  28.41 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  28.41 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  28.41 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  28.41 
 
 
438 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  28.41 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 
458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
449 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4166  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 
445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0754013 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4577  sensor protein BasS/PmrB  28.48 
 
 
366 aa  114  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  28.61 
 
 
1093 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4352  sensor protein BasS/PmrB  29.55 
 
 
363 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5625  sensor protein BasS/PmrB  29.55 
 
 
366 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4666  sensor protein BasS/PmrB  29.55 
 
 
363 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  24.86 
 
 
471 aa  113  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
456 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3880  histidine kinase  28.16 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  28.21 
 
 
441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 
461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3915  sensor protein BasS/PmrB  28.16 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  25.84 
 
 
469 aa  111  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  25.18 
 
 
446 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.94 
 
 
433 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 
445 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
452 aa  110  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
433 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4686  sensor protein BasS/PmrB  28.18 
 
 
359 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4553  sensor protein BasS/PmrB  28.18 
 
 
349 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BasR  27.83 
 
 
363 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4637  sensor protein BasS/PmrB  28.18 
 
 
359 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4637  sensor protein BasS/PmrB  28.18 
 
 
359 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576296  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4546  sensor protein BasS/PmrB  28.18 
 
 
359 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03944  hypothetical protein  27.83 
 
 
363 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
487 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
448 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
439 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1941  histidine kinase  29.14 
 
 
514 aa  108  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.531292  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
433 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 
444 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72241  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 
450 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
438 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>