More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6258 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6258  two component sensor kinase  100 
 
 		 440 aa  884    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0553015  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.94 
 
 		 450 aa  359  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  38.95 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0209  sensor histidine kinase  38.95 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0024043  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3975  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.57 
 
 		 438 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.242416  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 441 aa  309  5e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0460995  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 445 aa  309  6.999999999999999e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4962  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 448 aa  309  8e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3283  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.01 
 
 		 451 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3095  histidine kinase  41.67 
 
 		 457 aa  293  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5169  sensor histidine kinase  39.76 
 
 		 451 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2073  sensor histidine kinase  40.86 
 
 		 453 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0558  sensor histidine kinase  40.63 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0670  sensor histidine kinase  40.63 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539179  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0785  sensor histidine kinase  40.63 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.190623  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0489  sensor histidine kinase  40.77 
 
 		 722 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620999  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1623  sensor histidine kinase  40.63 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1976  sensor histidine kinase  40.63 
 
 		 453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0904  sensor histidine kinase  38.3 
 
 		 454 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616336  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5393  two-component signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 450 aa  273  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 456 aa  262  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 438 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.823775  normal  0.178217 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 449 aa  208  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3286  histidine kinase  32.58 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00148382  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1464  histidine kinase  33.84 
 
 		 469 aa  186  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.173941  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1753  histidine kinase  31.91 
 
 		 451 aa  177  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 451 aa  177  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.536058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3444  histidine kinase  29.81 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3149  sensor histidine kinase  32.16 
 
 		 440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.28591  hitchhiker  0.000661771 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 433 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  31.59 
 
 		 455 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 455 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 455 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  30.32 
 
 		 442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 445 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 456 aa  146  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 458 aa  143  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 458 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  28.41 
 
 		 438 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  28.41 
 
 		 438 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  28.41 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  28.41 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  28.41 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  28.41 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  28.41 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  28.19 
 
 		 449 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  28.63 
 
 		 438 aa  139  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1144  histidine kinase  26.86 
 
 		 475 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2595  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 441 aa  137  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  31.17 
 
 		 449 aa  137  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  31.11 
 
 		 454 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0135  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0665221  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  31.17 
 
 		 459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  31.17 
 
 		 459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  31.17 
 
 		 459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  31.17 
 
 		 459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  31.17 
 
 		 459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  27.95 
 
 		 463 aa  133  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  28.7 
 
 		 519 aa  132  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 450 aa  131  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 466 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  27.23 
 
 		 439 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  30.4 
 
 		 1093 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02898  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with QseB  27.36 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.760394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0674  histidine kinase  27.36 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  27.79 
 
 		 471 aa  129  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3204  sensor protein QseC  27.36 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  28.99 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02848  hypothetical protein  27.36 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4358  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 446 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 448 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3315  sensor protein QseC  27.36 
 
 		 449 aa  128  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0769555 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  28.05 
 
 		 448 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 448 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  27.54 
 
 		 471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  26.07 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  27.71 
 
 		 459 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 448 aa  127  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0671  sensor protein QseC  27.13 
 
 		 449 aa  126  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3460  sensor protein QseC  27.13 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 524 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3491  sensor protein QseC  27.13 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  26.1 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4335  sensor protein QseC  27.13 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 480 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.41 
 
 		 439 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 450 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>