More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0223 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
445 aa  897    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127602  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.64 
 
 
441 aa  514  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0024043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.19 
 
 
441 aa  508  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0460995  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.28 
 
 
426 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  44.39 
 
 
446 aa  352  7e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0209  sensor histidine kinase  44.39 
 
 
446 aa  352  7e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4962  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 
448 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480861  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5169  sensor histidine kinase  43.3 
 
 
451 aa  329  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2073  sensor histidine kinase  41.78 
 
 
453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0904  sensor histidine kinase  41.46 
 
 
454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0489  sensor histidine kinase  41.78 
 
 
722 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620999  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0785  sensor histidine kinase  41.55 
 
 
453 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.190623  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0558  sensor histidine kinase  41.55 
 
 
453 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1623  sensor histidine kinase  41.55 
 
 
453 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0670  sensor histidine kinase  41.55 
 
 
453 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539179  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1976  sensor histidine kinase  41.32 
 
 
453 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3095  histidine kinase  42.95 
 
 
457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3975  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 
438 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.242416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5393  two-component signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 
450 aa  319  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983917  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6258  two component sensor kinase  41.44 
 
 
440 aa  313  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0553015  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 
451 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3283  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 
456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0188318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 
456 aa  285  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 
438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 
438 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.823775  normal  0.178217 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6028  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
450 aa  243  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
461 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
449 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3286  histidine kinase  30.68 
 
 
450 aa  187  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00148382  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1144  histidine kinase  28.82 
 
 
475 aa  166  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931606  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1464  histidine kinase  30.28 
 
 
469 aa  163  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.173941  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
451 aa  155  9e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.536058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1753  histidine kinase  29.25 
 
 
451 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3149  sensor histidine kinase  32.04 
 
 
440 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.28591  hitchhiker  0.000661771 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
445 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  27.84 
 
 
438 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  27.84 
 
 
438 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  27.84 
 
 
438 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  27.84 
 
 
438 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  27.84 
 
 
438 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
445 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  27.84 
 
 
438 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  27.84 
 
 
438 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
461 aa  142  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  28.6 
 
 
438 aa  141  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2595  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 
441 aa  137  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
448 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
456 aa  130  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  27.87 
 
 
442 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  27.81 
 
 
454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
444 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.85 
 
 
433 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
433 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
448 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  28.07 
 
 
448 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
475 aa  126  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
448 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
444 aa  126  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
458 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
466 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3444  histidine kinase  26.76 
 
 
464 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2077  signal transduction histidine kinase sensor  27.42 
 
 
487 aa  124  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200991  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  27.84 
 
 
455 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
454 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
450 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  27.62 
 
 
449 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
461 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 
449 aa  121  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  27.53 
 
 
459 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0693  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
487 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 
452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166082  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  28.29 
 
 
471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  28.29 
 
 
471 aa  119  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 
458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
453 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4241  sensor protein QseC  23.97 
 
 
449 aa  117  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  30.7 
 
 
519 aa  116  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 
450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  29.11 
 
 
467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  32.57 
 
 
457 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3681  hypothetical protein  27.17 
 
 
455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.740643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.94 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2599  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 
450 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0620227 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
450 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  26.92 
 
 
446 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0125  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 
438 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0421257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  26.2 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  24.93 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 
439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  30.06 
 
 
449 aa  111  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3457  putative signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
453 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.805731  normal  0.295467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 
524 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>