More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6963 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6963  histidine kinase  100 
 
 		 432 aa  884    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.20821  normal  0.0498309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4554  histidine kinase  39.07 
 
 		 425 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00930403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6737  histidine kinase  36.67 
 
 		 421 aa  256  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  0.372172 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2731  twp-component sensor histidine kinase  34.47 
 
 		 422 aa  245  9e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0466  histidine kinase  35.76 
 
 		 422 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1450  histidine kinase  33.25 
 
 		 424 aa  207  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3157  histidine kinase  32.56 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2539  histidine kinase A domain protein  35.43 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3533  two-component sensor histidine kinase  31.98 
 
 		 419 aa  195  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4932  histidine kinase  33.65 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 424 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4883  histidine kinase  39.39 
 
 		 347 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.876275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2585  histidine kinase  34.19 
 
 		 444 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  decreased coverage  0.00983118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1333  histidine kinase A domain protein  34.04 
 
 		 412 aa  163  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0719  sensor histidine kinase  32.27 
 
 		 427 aa  160  4e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.420092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2455  ATP-binding region ATPase domain protein  31.23 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0530823  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1621  histidine kinase  30.61 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  27.07 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.91 
 
 		 513 aa  97.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1184  ATP-binding region ATPase domain protein  28.88 
 
 		 436 aa  96.7  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 531 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  29.53 
 
 		 526 aa  94  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  31.53 
 
 		 478 aa  93.6  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  32.46 
 
 		 343 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5020  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 474 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323054  normal  0.120297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.15 
 
 		 370 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 513 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 500 aa  90.5  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4099  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 431 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  32.1 
 
 		 389 aa  89.7  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 461 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  25.99 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 495 aa  89.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  31.43 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 478 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4077  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 494 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134335  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 517 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  27.67 
 
 		 441 aa  88.2  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 498 aa  88.2  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  26.51 
 
 		 471 aa  87.8  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 		 421 aa  87.8  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 519 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 480 aa  87.4  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 454 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 		 469 aa  87.4  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  31.73 
 
 		 389 aa  87  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4289  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 494 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 515 aa  86.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 405 aa  86.7  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  27.17 
 
 		 469 aa  86.7  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2297  Signal transduction histidine kinase-like  26.37 
 
 		 446 aa  86.7  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247505  hitchhiker  0.000082991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  30.04 
 
 		 474 aa  86.7  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 466 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 435 aa  86.3  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0409308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 453 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.671224  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  29.49 
 
 		 475 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  33.03 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  26.17 
 
 		 471 aa  86.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0804  histidine kinase  28.43 
 
 		 322 aa  85.9  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0156746  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3228  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 494 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8274  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3604  histidine kinase  31.51 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.097715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  32.89 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  25.14 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  28.52 
 
 		 517 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  27.39 
 
 		 508 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  30.82 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  28.83 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  29.5 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.54 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 476 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  24.54 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 515 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 515 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0247  ATPase domain-containing protein  30.47 
 
 		 628 aa  83.2  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  24.83 
 
 		 491 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3294  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  26.55 
 
 		 583 aa  83.2  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1765  sensor histidine kinase  29.8 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 501 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 501 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 468 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1730  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 479 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0670808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 501 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4079  histidine kinase  30.83 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 501 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 501 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  28.14 
 
 		 474 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>