More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0466 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0466  histidine kinase  100 
 
 		 422 aa  861    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3157  histidine kinase  59.61 
 
 		 407 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2539  histidine kinase A domain protein  35.24 
 
 		 417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2731  twp-component sensor histidine kinase  34.75 
 
 		 422 aa  233  7.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6963  histidine kinase  35.76 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.20821  normal  0.0498309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4554  histidine kinase  32.72 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00930403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2585  histidine kinase  30.41 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  decreased coverage  0.00983118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1333  histidine kinase A domain protein  31.04 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6737  histidine kinase  30.14 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  0.372172 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 424 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1450  histidine kinase  28.12 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4932  histidine kinase  30.07 
 
 		 426 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4883  histidine kinase  36.13 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.876275 
 
 
-
 
NC_002950  PG0719  sensor histidine kinase  29.81 
 
 		 427 aa  152  8.999999999999999e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.420092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3533  two-component sensor histidine kinase  29.74 
 
 		 419 aa  150  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2455  ATP-binding region ATPase domain protein  30.87 
 
 		 438 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0530823  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 458 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1184  ATP-binding region ATPase domain protein  30.04 
 
 		 436 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 465 aa  98.2  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 498 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.09 
 
 		 466 aa  97.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  27.47 
 
 		 497 aa  96.3  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 469 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  23.96 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 461 aa  94  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  27.84 
 
 		 446 aa  93.2  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0209  sensor histidine kinase  27.84 
 
 		 446 aa  93.2  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 469 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 469 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1033  histidine kinase  31.62 
 
 		 403 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  27.65 
 
 		 425 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.51 
 
 		 370 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 436 aa  91.3  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00289243  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 487 aa  90.9  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1621  histidine kinase  26.71 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  28.72 
 
 		 343 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0140  sensor histidine kinase  31.33 
 
 		 471 aa  90.1  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25340  signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 483 aa  90.1  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 375 aa  89.7  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.960828  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 472 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4039  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 460 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0904  sensor histidine kinase  28.12 
 
 		 454 aa  89.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616336  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 395 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  31.13 
 
 		 436 aa  88.2  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 515 aa  87.8  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  26.95 
 
 		 436 aa  87.8  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 362 aa  87.8  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 426 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.801726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 462 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 		 462 aa  86.7  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  28.03 
 
 		 454 aa  87  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  27.64 
 
 		 367 aa  86.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  26.6 
 
 		 344 aa  86.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  29.13 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  23.5 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  28.7 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  27.12 
 
 		 418 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  24.66 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18050  signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  29.52 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  25.93 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  25.93 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  25.93 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  25.93 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  26.46 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 513 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  29.55 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 490 aa  84.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.31 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  25.53 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  25.93 
 
 		 466 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  29.41 
 
 		 592 aa  83.6  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  29.82 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  28.16 
 
 		 508 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  25.93 
 
 		 466 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  30.14 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3618  histidine kinase  25.38 
 
 		 472 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  28.26 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 429 aa  82.8  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  26.87 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  25.66 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8630  histidine kinase  35.32 
 
 		 343 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 469 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  26.18 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  27.68 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  26.92 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  30.22 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>