More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25340 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_25340  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
483 aa  941    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 
395 aa  261  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907566  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  36.97 
 
 
425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 
426 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.801726  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  38.38 
 
 
436 aa  243  7e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  45.51 
 
 
413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.17 
 
 
416 aa  231  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5938  histidine kinase  37.04 
 
 
400 aa  229  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  43.09 
 
 
467 aa  226  8e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 
400 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1033  histidine kinase  44.38 
 
 
403 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0081  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
401 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.18 
 
 
370 aa  213  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.44 
 
 
448 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  40.06 
 
 
405 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  38.96 
 
 
343 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6644  histidine kinase  33.76 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
362 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4755  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.88 
 
 
362 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
435 aa  182  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0409308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
404 aa  180  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
473 aa  180  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333745  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 
385 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 
378 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.69 
 
 
375 aa  172  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.960828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7134  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
373 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  39.62 
 
 
367 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5650  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
394 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  39.53 
 
 
389 aa  169  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1425  histidine kinase  41.88 
 
 
392 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  39.07 
 
 
344 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  38.94 
 
 
389 aa  167  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5789  histidine kinase  39.17 
 
 
405 aa  160  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689027  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4513  histidine kinase  41.8 
 
 
382 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0449708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0471  histidine kinase  31.81 
 
 
370 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 
378 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
469 aa  150  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
459 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
469 aa  147  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
504 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  28.03 
 
 
461 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8630  histidine kinase  40.39 
 
 
343 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  31.59 
 
 
469 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  32.51 
 
 
398 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
470 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
406 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  31.87 
 
 
486 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  30.23 
 
 
477 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
467 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
475 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  27.49 
 
 
386 aa  132  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
467 aa  126  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  31.13 
 
 
459 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  31.82 
 
 
443 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
518 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  32.03 
 
 
518 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  31.34 
 
 
379 aa  124  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  27.87 
 
 
436 aa  123  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
481 aa  123  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
468 aa  123  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  30.41 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  26.72 
 
 
436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  35.33 
 
 
508 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
517 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  33.75 
 
 
478 aa  121  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 
420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  29.02 
 
 
592 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 
452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
513 aa  120  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02950  signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
544 aa  120  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
515 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
515 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
519 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  31.66 
 
 
583 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  31.21 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
515 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  32.49 
 
 
490 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.67 
 
 
513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  30.59 
 
 
501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  28.96 
 
 
471 aa  118  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  30.3 
 
 
499 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  27.59 
 
 
436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  32.26 
 
 
517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.42 
 
 
515 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.33 
 
 
512 aa  117  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  24.93 
 
 
397 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 
489 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  30.79 
 
 
431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  28.69 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
490 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.44 
 
 
446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  31.86 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  30.66 
 
 
475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  27.59 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>