More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1628 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  100 
 
 		 425 aa  862    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  46.43 
 
 		 467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  45.71 
 
 		 436 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  45.83 
 
 		 413 aa  289  6e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.05 
 
 		 416 aa  287  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.24 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.01 
 
 		 448 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 		 426 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.801726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1033  histidine kinase  43.08 
 
 		 403 aa  259  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5938  histidine kinase  38.77 
 
 		 400 aa  246  8e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25340  signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 483 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6644  histidine kinase  38.94 
 
 		 391 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 362 aa  216  7e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.3 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.25 
 
 		 400 aa  210  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  45.13 
 
 		 343 aa  209  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 404 aa  206  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  39.51 
 
 		 389 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  39.94 
 
 		 389 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  42.05 
 
 		 405 aa  203  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 		 378 aa  202  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 375 aa  201  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.960828  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  44.01 
 
 		 344 aa  200  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1425  histidine kinase  39.23 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0081  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 401 aa  196  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4755  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.02 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4513  histidine kinase  40.57 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0449708  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7134  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 373 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  36.69 
 
 		 367 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 435 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0409308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  35.86 
 
 		 398 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 473 aa  177  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5789  histidine kinase  35.48 
 
 		 405 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 469 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 469 aa  153  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  34.28 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0471  histidine kinase  31.17 
 
 		 370 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  35.48 
 
 		 469 aa  149  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5650  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 455 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26830  signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  32.49 
 
 		 477 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 467 aa  141  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 534 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 504 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  27.27 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 490 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  28.48 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 480 aa  133  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 475 aa  133  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8630  histidine kinase  30.23 
 
 		 343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.7 
 
 		 466 aa  130  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 438 aa  130  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  31.79 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  29.87 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  30.95 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  35.02 
 
 		 555 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  34.45 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  32.86 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 471 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  30.51 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 487 aa  127  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  34.06 
 
 		 475 aa  126  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7228  two component sensor kinase  34.53 
 
 		 484 aa  126  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  31.56 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  33.22 
 
 		 583 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 498 aa  123  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 477 aa  123  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 468 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 468 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 468 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.33 
 
 		 447 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  28.12 
 
 		 386 aa  122  9e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  29.97 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 537 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  29.34 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  29.47 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3604  histidine kinase  32.86 
 
 		 483 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  31.73 
 
 		 506 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  29.64 
 
 		 592 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  30.61 
 
 		 443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  33.45 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  29.87 
 
 		 457 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  29.87 
 
 		 457 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0512  histidine kinase  32.18 
 
 		 489 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>