More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2731 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2731  twp-component sensor histidine kinase  100 
 
 		 422 aa  837    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3157  histidine kinase  33.98 
 
 		 407 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6963  histidine kinase  34.47 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.20821  normal  0.0498309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0466  histidine kinase  34.36 
 
 		 422 aa  226  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2539  histidine kinase A domain protein  34.87 
 
 		 417 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4554  histidine kinase  30.84 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00930403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2585  histidine kinase  31.55 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  decreased coverage  0.00983118 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6737  histidine kinase  30.35 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  0.372172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4932  histidine kinase  32.39 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4883  histidine kinase  39.13 
 
 		 347 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.876275 
 
 
-
 
NC_002950  PG0719  sensor histidine kinase  30.17 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.420092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1333  histidine kinase A domain protein  29.29 
 
 		 412 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3533  two-component sensor histidine kinase  32.79 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1450  histidine kinase  30.21 
 
 		 424 aa  169  6e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 424 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  28.78 
 
 		 418 aa  122  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2455  ATP-binding region ATPase domain protein  30.81 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0530823  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  29.97 
 
 		 445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 459 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 		 478 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 445 aa  119  9e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1184  ATP-binding region ATPase domain protein  27.35 
 
 		 436 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  27.52 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.75 
 
 		 500 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  27.73 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  27.73 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  25.47 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 461 aa  107  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.49 
 
 		 495 aa  106  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  26.8 
 
 		 425 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  23.84 
 
 		 343 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  24.46 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 453 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0354974  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 469 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  25.55 
 
 		 436 aa  100  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  23.58 
 
 		 474 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 469 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 469 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  28.52 
 
 		 369 aa  100  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.46 
 
 		 455 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  23.4 
 
 		 421 aa  99.8  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.2 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1478  histidine kinase  36.97 
 
 		 270 aa  99.4  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000106668  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  24.72 
 
 		 398 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  28.1 
 
 		 503 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 465 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.960828  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.62 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  26.06 
 
 		 405 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.48 
 
 		 459 aa  97.4  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 462 aa  97.4  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 496 aa  97.4  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  24.28 
 
 		 466 aa  97.1  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 376 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.65 
 
 		 370 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1621  histidine kinase  26.52 
 
 		 421 aa  97.1  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 376 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 467 aa  96.3  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4755  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.43 
 
 		 362 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_003296  RS00403  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  24.52 
 
 		 492 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00328679  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  27.12 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 438 aa  95.1  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0209  sensor histidine kinase  27.12 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  22.72 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  22.72 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  22.72 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  22.72 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  22.72 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  22.72 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  22.72 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7134  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 362 aa  94.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.28 
 
 		 448 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 		 445 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2130  histidine kinase  26.74 
 
 		 411 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  29.9 
 
 		 376 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  26.16 
 
 		 367 aa  94  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  28.51 
 
 		 483 aa  94  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 		 445 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  25.89 
 
 		 555 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.39 
 
 		 454 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 502 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  22.72 
 
 		 438 aa  92.8  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 		 471 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0988  sensor histidine kinase ArlS  27.36 
 
 		 456 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101467  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.23 
 
 		 456 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  23.61 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.38 
 
 		 455 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.38 
 
 		 455 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.92 
 
 		 500 aa  92  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 422 aa  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 471 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>