More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4554 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4554  histidine kinase  100 
 
 		 425 aa  868    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00930403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6737  histidine kinase  42.39 
 
 		 421 aa  323  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  0.372172 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6963  histidine kinase  38.12 
 
 		 432 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.20821  normal  0.0498309 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2731  twp-component sensor histidine kinase  30.84 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0466  histidine kinase  32.72 
 
 		 422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3157  histidine kinase  32.62 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2539  histidine kinase A domain protein  29.51 
 
 		 417 aa  180  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4883  histidine kinase  38.75 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.876275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4932  histidine kinase  31.04 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3533  two-component sensor histidine kinase  35.51 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_002950  PG0719  sensor histidine kinase  33.12 
 
 		 427 aa  167  4e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.420092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1333  histidine kinase A domain protein  29.07 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2585  histidine kinase  28.28 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  decreased coverage  0.00983118 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1450  histidine kinase  26.89 
 
 		 424 aa  139  7e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2455  ATP-binding region ATPase domain protein  26.15 
 
 		 438 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0530823  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1184  ATP-binding region ATPase domain protein  29.11 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 		 421 aa  101  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 463 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 422 aa  99.8  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 459 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 459 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 459 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 461 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 455 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 455 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  27.63 
 
 		 455 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 456 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 469 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 461 aa  90.1  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 377 aa  89.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  28.46 
 
 		 386 aa  89.7  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4099  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 431 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2038  ATP-binding region ATPase domain protein  30.09 
 
 		 473 aa  87.4  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  29.86 
 
 		 460 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  28.49 
 
 		 450 aa  87  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 		 438 aa  87  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 458 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 445 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 405 aa  86.7  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  30.33 
 
 		 460 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1621  histidine kinase  27.31 
 
 		 421 aa  86.7  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 440 aa  86.3  9e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000024219  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 458 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  26.01 
 
 		 583 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0804  histidine kinase  30.95 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0156746  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1492  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 624 aa  84.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.411872  decreased coverage  0.00494446 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.18 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3294  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  27.81 
 
 		 474 aa  83.6  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.14 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0941  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.14 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  28.11 
 
 		 523 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4497  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  23.88 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269755 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  25.09 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2176  hypothetical protein  28.27 
 
 		 400 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01831  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4485  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.82 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  27.93 
 
 		 505 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4373  sensor histidine kinase ColS  23.3 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  23.5 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  27.41 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  27.93 
 
 		 505 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  27.93 
 
 		 505 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  23.5 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1930  histidine kinase  24.3 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.824341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  23.5 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  28.76 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  26.42 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.18 
 
 		 513 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  25.12 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  25.12 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 531 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  23.58 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  25.12 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  25.12 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  25.12 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  25.44 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  25.12 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  25.12 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  26.55 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  23.24 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  23.4 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  27.65 
 
 		 505 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.78 
 
 		 447 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  27.64 
 
 		 483 aa  80.1  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  27.84 
 
 		 518 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0970  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.73 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>