More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3533 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3533  two-component sensor histidine kinase  100 
 
 		 419 aa  840    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4932  histidine kinase  41.41 
 
 		 426 aa  302  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1450  histidine kinase  39.9 
 
 		 424 aa  281  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0719  sensor histidine kinase  33.96 
 
 		 427 aa  230  3e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.420092 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6963  histidine kinase  31.89 
 
 		 432 aa  213  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.20821  normal  0.0498309 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6737  histidine kinase  30.62 
 
 		 421 aa  203  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  0.372172 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2731  twp-component sensor histidine kinase  32.79 
 
 		 422 aa  201  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4554  histidine kinase  31.99 
 
 		 425 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00930403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3157  histidine kinase  30.46 
 
 		 407 aa  182  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4883  histidine kinase  38.66 
 
 		 347 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.876275 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2539  histidine kinase A domain protein  32.18 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2585  histidine kinase  33.13 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  decreased coverage  0.00983118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0466  histidine kinase  29.74 
 
 		 422 aa  173  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1333  histidine kinase A domain protein  31.41 
 
 		 412 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1621  histidine kinase  31.55 
 
 		 421 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1184  ATP-binding region ATPase domain protein  32.28 
 
 		 436 aa  106  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 459 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 463 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 459 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  26.69 
 
 		 438 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  26.69 
 
 		 438 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  26.69 
 
 		 438 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  26.69 
 
 		 438 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  26.69 
 
 		 438 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  26.69 
 
 		 438 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  26.69 
 
 		 438 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2455  ATP-binding region ATPase domain protein  33.92 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0530823  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  30.96 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 459 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  26.26 
 
 		 438 aa  100  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 437 aa  100  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  24.85 
 
 		 474 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  30.54 
 
 		 460 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 478 aa  96.3  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 500 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3457  putative signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.805731  normal  0.295467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 439 aa  93.6  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5020  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 474 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323054  normal  0.120297 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 597 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 495 aa  92.8  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 		 445 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 		 504 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 		 445 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  22.52 
 
 		 473 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4040  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45469 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.870976  normal  0.849775 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 597 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54500  two-component sensor  26.27 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.452392 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  29.72 
 
 		 369 aa  91.3  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 462 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 466 aa  91.3  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  26.94 
 
 		 446 aa  90.1  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 509 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0209  sensor histidine kinase  26.94 
 
 		 446 aa  90.1  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3294  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 432 aa  90.1  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  23.08 
 
 		 454 aa  89.7  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 		 448 aa  89.7  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  26.69 
 
 		 446 aa  89.7  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  24.38 
 
 		 439 aa  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 385 aa  89.7  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  25.49 
 
 		 473 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 448 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 500 aa  89.4  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 465 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  25.41 
 
 		 459 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 		 462 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  25.41 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  25.41 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1969  histidine kinase  30.47 
 
 		 463 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  23.92 
 
 		 471 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  25.41 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  25.41 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 458 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.55 
 
 		 433 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  26.52 
 
 		 1093 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 457 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  26.67 
 
 		 483 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  26.22 
 
 		 449 aa  87  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 433 aa  87  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  25.17 
 
 		 418 aa  87  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  33.02 
 
 		 336 aa  86.7  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 475 aa  86.7  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2267  histidine kinase  25 
 
 		 488 aa  86.7  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.643176  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  28 
 
 		 443 aa  86.3  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 489 aa  86.3  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 515 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3592  histidine kinase  28.37 
 
 		 567 aa  86.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000490069  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  31.56 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 433 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 		 465 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  25.71 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5789  histidine kinase  30.8 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689027  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>