More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1425 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1425  histidine kinase  100 
 
 
392 aa  761    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7134  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.37 
 
 
373 aa  487  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4755  Signal transduction histidine kinase-like protein  65.61 
 
 
362 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.44 
 
 
375 aa  466  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.960828  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  67.47 
 
 
367 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.84 
 
 
385 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5789  histidine kinase  63.38 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689027  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4513  histidine kinase  58.52 
 
 
382 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0449708  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.63 
 
 
378 aa  297  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.49 
 
 
378 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  42.52 
 
 
413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  38.34 
 
 
467 aa  209  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  39.21 
 
 
436 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26830  signal transduction histidine kinase  49.47 
 
 
368 aa  206  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 
395 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907566  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.14 
 
 
448 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  43.52 
 
 
343 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  39.23 
 
 
425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5938  histidine kinase  38.75 
 
 
400 aa  196  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 
416 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  42.62 
 
 
344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 
362 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  41.75 
 
 
389 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1033  histidine kinase  44.44 
 
 
403 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  41.67 
 
 
389 aa  179  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.56 
 
 
370 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
426 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.801726  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  41.88 
 
 
405 aa  176  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6644  histidine kinase  34.76 
 
 
391 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157131 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
473 aa  170  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333745  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25340  signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 
483 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0081  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
401 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  36.07 
 
 
398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
404 aa  156  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5650  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
394 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0471  histidine kinase  34.52 
 
 
370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  36.57 
 
 
469 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  29.83 
 
 
461 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 
406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  31.89 
 
 
592 aa  139  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 
435 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0409308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
469 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
469 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
455 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
487 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
490 aa  126  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  31.56 
 
 
503 aa  126  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
377 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
504 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
477 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  32.25 
 
 
486 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0050  histidine kinase  36 
 
 
455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
470 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  26.85 
 
 
386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
455 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0023  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
455 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  33.78 
 
 
466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
498 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  30.03 
 
 
472 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  32.46 
 
 
475 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
440 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
524 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
471 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
515 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0039  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0031  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8630  histidine kinase  33.02 
 
 
343 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
436 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
438 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  36.64 
 
 
438 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  32.09 
 
 
477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  30.39 
 
 
469 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  34.38 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2945  histidine kinase  32.33 
 
 
451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.694532  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  34.83 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  34.83 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  34.83 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  34.83 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  34.83 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  35.76 
 
 
471 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  31.02 
 
 
436 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 
438 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  34.48 
 
 
438 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  37.01 
 
 
473 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3399  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 
467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392357  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  34.48 
 
 
438 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  31.02 
 
 
457 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  31.02 
 
 
457 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  37.55 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  30.72 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  30.36 
 
 
436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02950  signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>