More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5938 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5938  histidine kinase  100 
 
 		 400 aa  796    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.14 
 
 		 426 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.801726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  49.1 
 
 		 448 aa  318  9e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  47.31 
 
 		 436 aa  315  7e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1033  histidine kinase  49.5 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 		 416 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  47.97 
 
 		 413 aa  299  7e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  45.66 
 
 		 467 aa  293  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.63 
 
 		 395 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0081  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 401 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  38.77 
 
 		 425 aa  249  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25340  signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 483 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 400 aa  226  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.18 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 		 404 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  35.91 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  44.98 
 
 		 389 aa  209  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  44.98 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  43.15 
 
 		 343 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6644  histidine kinase  36.79 
 
 		 391 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.960828  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 473 aa  202  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1425  histidine kinase  38.31 
 
 		 392 aa  196  8.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  41.4 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  43.79 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7134  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 373 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5789  histidine kinase  36.22 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  42.46 
 
 		 367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4755  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.92 
 
 		 362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0471  histidine kinase  36.11 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 435 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0409308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5650  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 394 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 378 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 469 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4513  histidine kinase  35.05 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0449708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 469 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8630  histidine kinase  32.67 
 
 		 343 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 504 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  34.95 
 
 		 469 aa  146  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  30.45 
 
 		 461 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 469 aa  142  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  33.55 
 
 		 459 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  31.56 
 
 		 477 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 454 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  38.49 
 
 		 583 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  40.41 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 458 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  33.68 
 
 		 475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  29.43 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.532357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  32.79 
 
 		 486 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  31.94 
 
 		 469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 537 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 377 aa  130  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  31.29 
 
 		 472 aa  129  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  32.09 
 
 		 463 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  29.32 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  35.28 
 
 		 475 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 487 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 489 aa  126  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 469 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 454 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  32.76 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  32.96 
 
 		 458 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  31.33 
 
 		 481 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 493 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 458 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.6 
 
 		 461 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 474 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 534 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.28 
 
 		 461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.91 
 
 		 453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.28 
 
 		 461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 498 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  30.39 
 
 		 592 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 481 aa  121  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0920  histidine kinase  31.8 
 
 		 481 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.651175 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  34.09 
 
 		 558 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  31.39 
 
 		 453 aa  119  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 455 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  32.1 
 
 		 468 aa  119  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  35.64 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  33.78 
 
 		 555 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  30.29 
 
 		 482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 458 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>