More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6644 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6644  histidine kinase  100 
 
 		 391 aa  763    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157131 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  44.13 
 
 		 413 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 		 416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  41.47 
 
 		 467 aa  229  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.68 
 
 		 448 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.9 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  38.85 
 
 		 436 aa  226  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.99 
 
 		 370 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5650  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  38.94 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  45.24 
 
 		 344 aa  216  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5938  histidine kinase  36.79 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  43.67 
 
 		 389 aa  209  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  41.28 
 
 		 343 aa  209  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 426 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.801726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  43.33 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  39 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0471  histidine kinase  39.84 
 
 		 370 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1033  histidine kinase  41.52 
 
 		 403 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0081  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  36.41 
 
 		 398 aa  193  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 362 aa  186  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25340  signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 483 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1425  histidine kinase  34.76 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4755  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.75 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.960828  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 378 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7134  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 373 aa  170  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5789  histidine kinase  35.23 
 
 		 405 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 435 aa  159  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0409308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 469 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  36.68 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4513  histidine kinase  40.53 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0449708  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 378 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4805  histidine kinase  46.5 
 
 		 204 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.671641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8630  histidine kinase  33.25 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 470 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 455 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  31.06 
 
 		 461 aa  145  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  34.53 
 
 		 486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 489 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 464 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 469 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  34.63 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 478 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 469 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 469 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  34.69 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 472 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  31.17 
 
 		 481 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 504 aa  133  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 377 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  31.55 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.532357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  26.33 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.98 
 
 		 466 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  30.9 
 
 		 458 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 459 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  33.66 
 
 		 442 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 471 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.94 
 
 		 457 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  33.56 
 
 		 555 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  31.21 
 
 		 469 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  36.71 
 
 		 454 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 495 aa  126  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 513 aa  125  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 537 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  26.71 
 
 		 497 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 352 aa  123  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 452 aa  123  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 471 aa  123  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 490 aa  123  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 515 aa  122  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3399  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 467 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392357  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 500 aa  122  9e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 484 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 534 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7228  two component sensor kinase  35.49 
 
 		 484 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 469 aa  120  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 467 aa  119  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 475 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3266  histidine kinase  31.37 
 
 		 476 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  30.64 
 
 		 448 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  31.96 
 
 		 516 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  30.98 
 
 		 459 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  34.1 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>