More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26830 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26830  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 368 aa  717    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1425  histidine kinase  49.47 
 
 		 392 aa  297  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.93 
 
 		 375 aa  290  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.960828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7134  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.74 
 
 		 373 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4755  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.11 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.11 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  45.86 
 
 		 367 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4513  histidine kinase  49.04 
 
 		 382 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0449708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5789  histidine kinase  46.38 
 
 		 405 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  39.24 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  38.65 
 
 		 436 aa  203  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  39.52 
 
 		 467 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.62 
 
 		 448 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 416 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  43.97 
 
 		 413 aa  186  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.01 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 400 aa  182  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  42.01 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  43.26 
 
 		 405 aa  179  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1033  histidine kinase  42.96 
 
 		 403 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 		 362 aa  178  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  40.13 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  40.88 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0081  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 		 401 aa  170  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25340  signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 483 aa  169  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  40.88 
 
 		 389 aa  169  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.801726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5938  histidine kinase  33.93 
 
 		 400 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  36.58 
 
 		 398 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 473 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6644  histidine kinase  38.89 
 
 		 391 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0409308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5650  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 394 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0471  histidine kinase  32.89 
 
 		 370 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  34.23 
 
 		 592 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 459 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  28.39 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 524 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 515 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 545 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.89 
 
 		 466 aa  122  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 498 aa  122  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  25.83 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  31.29 
 
 		 457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  31.42 
 
 		 448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 490 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  31.29 
 
 		 436 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 529 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  31.29 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  27.78 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  31.19 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 470 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  31.33 
 
 		 472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  30.61 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  30.61 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  28.92 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  36.59 
 
 		 467 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 479 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  31.61 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  34.46 
 
 		 583 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  33.88 
 
 		 475 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  34.12 
 
 		 477 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 513 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.532357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  33.8 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  34.51 
 
 		 459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  32.59 
 
 		 452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 504 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 377 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  33.56 
 
 		 469 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  31.44 
 
 		 449 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  31.27 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  30.75 
 
 		 465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  32.6 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  33.54 
 
 		 476 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  32.52 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 480 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 534 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 504 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  33.1 
 
 		 480 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 462 aa  110  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  31.1 
 
 		 449 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 490 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3007  histidine kinase  37.72 
 
 		 414 aa  110  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 449 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 455 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 486 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>