More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4006 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4622  sensor histidine kinase  79.13 
 
 		 413 aa  661    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4195  histidine kinase A domain-containing protein  81.6 
 
 		 415 aa  683    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4006  histidine kinase A domain-containing protein  100 
 
 		 413 aa  850    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3797  ATPase domain-containing protein  79.85 
 
 		 413 aa  666    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4327  histidine kinase A domain-containing protein  82.08 
 
 		 415 aa  691    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0692  histidine kinase A domain-containing protein  55.75 
 
 		 404 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3576  histidine kinase A domain-containing protein  56.07 
 
 		 406 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 418 aa  107  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2061  putative two-component sensor  30.97 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1973  histidine kinase  32.86 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.73664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2810  histidine kinase  30.97 
 
 		 425 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24340  putative two-component sensor  34.68 
 
 		 431 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4638  sensor histidine kinase  29.2 
 
 		 430 aa  94.4  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2252  histidine kinase  24.8 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2297  Signal transduction histidine kinase-like  23 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247505  hitchhiker  0.000082991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003061  two-component system sensor protein  27.62 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02793  histidine kinase  23.91 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353371 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  26.22 
 
 		 455 aa  73.2  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0334  histidine kinase  26.78 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000559138  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  26.61 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  24.35 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05571  sensory transduction protein kinase  25.66 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1866  sensor histidine kinase  26.1 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  23.37 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  26.06 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001594  two-component system sensor protein  23.94 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000479105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3631  histidine kinase  25.33 
 
 		 449 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000017519 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3439  Signal transduction histidine kinase-like  24.83 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359307 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.01 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04467  two-component system (histidine kinase) sensor protein requried for AvrXa21 activity H (raxH)  27.34 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17790  sensory histidine protein kinase, two-component, ColS  25.54 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2642  sensor histidine kinase  28.35 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.244154  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  27.88 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3010  histidine kinase A domain-containing protein  24.01 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.728657  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2374  sensor histidine kinase  26.15 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171494  normal  0.151024 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 686 aa  63.9  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.67 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0417  putative sensor kinase protein  27.04 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  25.57 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  26.69 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.33 
 
 		 454 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0988  sensor histidine kinase ArlS  24.91 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101467  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4373  sensor histidine kinase ColS  25.4 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  24.05 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4069  sensor histidine kinase  25.4 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00769633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0313  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 580 aa  60.5  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1930  histidine kinase  25.47 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.824341  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 		 475 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 495 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  25.82 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 		 572 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6258  two component sensor kinase  25.98 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0553015  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4951  putative two-component sensor  24.45 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2595  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.85 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56940  putative two-component sensor  25.32 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2909  putative sensor histidine kinase SrrB  25.96 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2892  sensor histidine kinase SrrB, putative  22.34 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000807575  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  23.23 
 
 		 608 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.19 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  24.67 
 
 		 573 aa  57  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  25.37 
 
 		 523 aa  57  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 		 500 aa  57  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  21.97 
 
 		 447 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 500 aa  57  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0153  histidine kinase  23.59 
 
 		 411 aa  57  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.519807  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.671224  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  25.6 
 
 		 477 aa  57  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0736  histidine kinase  22.76 
 
 		 508 aa  56.6  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2665  histidine kinase  24.12 
 
 		 458 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 485 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  24.67 
 
 		 573 aa  56.2  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339832  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2668  sensor histidine kinase SrrB  24.12 
 
 		 458 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 477 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2861  sensor histidine kinase SrrB  24.12 
 
 		 458 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.933521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.44 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0489  Signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 470 aa  56.2  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1042  phosphate regulon sensor protein  25.76 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3301  phosphate regulon sensor protein  30.59 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 		 873 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2866  putative sensor histidine kinase SrrB  24.12 
 
 		 458 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000772439 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  23.74 
 
 		 437 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2109  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 510 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  24.07 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>