More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001594 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05571  sensory transduction protein kinase  81.11 
 
 		 413 aa  714    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001594  two-component system sensor protein  100 
 
 		 413 aa  862    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000479105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0334  histidine kinase  59.81 
 
 		 418 aa  522  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000559138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3010  histidine kinase A domain-containing protein  60.53 
 
 		 420 aa  519  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.728657  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4638  sensor histidine kinase  51.08 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0417  putative sensor kinase protein  57.55 
 
 		 391 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2061  putative two-component sensor  28.75 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  26.16 
 
 		 405 aa  112  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02793  histidine kinase  26.96 
 
 		 426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 		 423 aa  109  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  22.95 
 
 		 435 aa  103  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 		 420 aa  103  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24340  putative two-component sensor  28.3 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339832  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003061  two-component system sensor protein  25.19 
 
 		 429 aa  97.4  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  25.36 
 
 		 420 aa  96.7  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2297  Signal transduction histidine kinase-like  23.19 
 
 		 446 aa  96.3  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247505  hitchhiker  0.000082991 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  25.24 
 
 		 455 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.2 
 
 		 430 aa  94.4  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  22 
 
 		 423 aa  94  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  26.36 
 
 		 438 aa  93.6  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 422 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1973  histidine kinase  26.51 
 
 		 422 aa  91.3  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.73664 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2642  sensor histidine kinase  25.68 
 
 		 416 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.244154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2374  sensor histidine kinase  24.82 
 
 		 434 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171494  normal  0.151024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1866  sensor histidine kinase  24.01 
 
 		 421 aa  90.1  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2810  histidine kinase  24.44 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17790  sensory histidine protein kinase, two-component, ColS  25.11 
 
 		 421 aa  87  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2252  histidine kinase  26.67 
 
 		 410 aa  87  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3631  histidine kinase  27.11 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.57 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56940  putative two-component sensor  24.94 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 422 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000017519 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04467  two-component system (histidine kinase) sensor protein requried for AvrXa21 activity H (raxH)  24.51 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  24.16 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4069  sensor histidine kinase  24.86 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00769633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.56 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0147  signal transduction histidine kinase-like protein  25 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4951  putative two-component sensor  24.8 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4485  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4327  histidine kinase A domain-containing protein  24.53 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4497  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269755 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4195  histidine kinase A domain-containing protein  24.53 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0941  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  28.04 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1046  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4373  sensor histidine kinase ColS  25.07 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3576  histidine kinase A domain-containing protein  27.59 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0970  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3797  ATPase domain-containing protein  24.91 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0692  histidine kinase A domain-containing protein  27.73 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2130  histidine kinase  23.4 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4622  sensor histidine kinase  26.73 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1243  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1930  histidine kinase  25.25 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.53323  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00327402  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1930  histidine kinase  24.93 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.824341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 465 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0719  sensor histidine kinase  21.92 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.420092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1828  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 466 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0770919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2833  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 		 437 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.643319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  24.67 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 465 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000014063  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00272877  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1886  ATPase domain-containing protein  25.71 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  29.2 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2398  histidine kinase  25.7 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00201135  normal  0.0208658 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0140  sensor histidine kinase  25.11 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2105  sensor protein YgiY, putative  26.23 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3439  Signal transduction histidine kinase-like  21.63 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359307 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  23.89 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4883  histidine kinase  26.97 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.876275 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.3 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.29 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0367152  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3007  histidine kinase  28.86 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  23.53 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.810358  hitchhiker  0.00733319 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5573  sensor histidine kinase  25.66 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0988  sensor histidine kinase ArlS  24.39 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101467  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.53 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0153  histidine kinase  22.14 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.519807  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 		 546 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 		 500 aa  58.9  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  23.81 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3015  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307553 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0643  histidine kinase  25.87 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  24.65 
 
 		 497 aa  58.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.9 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1159  heavy metal sensor kinase subfamily  24.09 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.433807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>