More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2369 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2369  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 461 aa  912    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.15701 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  24.49 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 421 aa  107  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  26.7 
 
 		 481 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  24.42 
 
 		 436 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  24.94 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  31.77 
 
 		 566 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 469 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 515 aa  103  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  26.18 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1970  hypothetical protein  25.43 
 
 		 449 aa  101  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.310408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  27.27 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  25.75 
 
 		 463 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  23.96 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  22.82 
 
 		 457 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  24.55 
 
 		 461 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  22.82 
 
 		 457 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 524 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 		 614 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  25.83 
 
 		 463 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  25.83 
 
 		 463 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  26.99 
 
 		 491 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  25.17 
 
 		 463 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 438 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  24.24 
 
 		 463 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  23.64 
 
 		 462 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.79 
 
 		 466 aa  97.8  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.95 
 
 		 613 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  25.84 
 
 		 463 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.31 
 
 		 465 aa  97.4  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 436 aa  97.1  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  31.06 
 
 		 437 aa  97.1  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 494 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 483 aa  96.7  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 471 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  30.85 
 
 		 389 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  25.87 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  22.96 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  24.67 
 
 		 463 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  24.76 
 
 		 458 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 462 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 479 aa  95.1  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  30.85 
 
 		 389 aa  94.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 362 aa  94.4  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 422 aa  94.4  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1046  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 444 aa  94  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0496  two component sensor histidine kinase  26.87 
 
 		 481 aa  93.6  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  22.02 
 
 		 491 aa  93.2  8e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  24.09 
 
 		 490 aa  93.2  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0736  histidine kinase  27.27 
 
 		 508 aa  92.4  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3399  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24 
 
 		 467 aa  93.2  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392357  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2230  histidine kinase  25.47 
 
 		 494 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  30.17 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  23.93 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  23.93 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  24.86 
 
 		 586 aa  92  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  27.86 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 498 aa  92.4  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  27.98 
 
 		 555 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  25.89 
 
 		 647 aa  91.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 513 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  31.4 
 
 		 508 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 595 aa  91.7  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00296366  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 455 aa  91.3  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  24.56 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1243  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 438 aa  90.9  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 		 466 aa  90.9  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1599  ATPase domain-containing protein  31.62 
 
 		 453 aa  91.3  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  23.55 
 
 		 486 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.22 
 
 		 451 aa  90.5  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 607 aa  90.9  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  20.22 
 
 		 451 aa  90.5  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  23.03 
 
 		 369 aa  90.9  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  29.45 
 
 		 475 aa  90.5  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 477 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  23.31 
 
 		 456 aa  90.1  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  26.74 
 
 		 423 aa  90.1  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 504 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 467 aa  90.1  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 445 aa  90.1  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1491  histidine kinase  24.55 
 
 		 444 aa  90.1  8e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  25.08 
 
 		 503 aa  89.7  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  29.03 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2314  histidine kinase  26.05 
 
 		 487 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  25.25 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  26.12 
 
 		 445 aa  89.7  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 369 aa  89.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0275  histidine kinase  22.19 
 
 		 456 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.937393  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  29.85 
 
 		 343 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000580  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  27.34 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00239122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  28.91 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 		 470 aa  89  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 478 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 485 aa  89  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1033  histidine kinase  29.51 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.92 
 
 		 464 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>