More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0762 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0762  sensor histidine kinase  100 
 
 		 410 aa  819    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00585003  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0810  sensor histidine kinase  64.71 
 
 		 425 aa  531  1e-150  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00160023  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1062  sensor histidine kinase  61.52 
 
 		 413 aa  509  1e-143  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0111491  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0979  sensor histidine kinase  62.25 
 
 		 412 aa  480  1e-134  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1385  histidine kinase HAMP region domain protein  54.41 
 
 		 411 aa  449  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543879  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0781  two-component sensor histidine kinase  51.59 
 
 		 414 aa  396  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1361  sensor histidine kinase  52.18 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1240  sensor histidine kinase  51.42 
 
 		 390 aa  360  3e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000082564  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0499  sensor histidine kinase  51.42 
 
 		 390 aa  358  6e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00768788  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1758  histidine kinase  36.06 
 
 		 424 aa  259  9e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0565  histidine kinase HAMP region domain protein  32.84 
 
 		 415 aa  219  7e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1136  two-component sensor  34.04 
 
 		 419 aa  216  4e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1359  HAMP domain-containing protein  34.88 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0196913  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0967  proline permease  35.12 
 
 		 418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.180674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2095  histidine kinase A domain protein  32.84 
 
 		 412 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1146  two-component sensor  41.75 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0495  two-component sensor histidine kinase  40.94 
 
 		 410 aa  179  8e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1398  sensor histidine kinase  31.14 
 
 		 411 aa  173  5e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0463  sensor histidine kinase  33.43 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000241496  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00345482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1278  sensor histidine kinase  33.82 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00689903  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2130  histidine kinase HAMP region domain protein  31.51 
 
 		 418 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0451  putative putative two-component sensor  33.21 
 
 		 405 aa  127  5e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.17 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  25.36 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.64 
 
 		 471 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  27.92 
 
 		 449 aa  92.8  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 449 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 426 aa  92.8  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 449 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 488 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.650213 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 459 aa  90.1  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 469 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.14 
 
 		 449 aa  89.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  27.37 
 
 		 449 aa  89  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  25.57 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 		 454 aa  89  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  26.53 
 
 		 412 aa  89  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  21.79 
 
 		 449 aa  87  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 454 aa  86.7  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 		 601 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000024219  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  23.65 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  21.43 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.15 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  26.1 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  26.05 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4686  sensor protein BasS/PmrB  25.28 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4637  sensor protein BasS/PmrB  25.28 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.2 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4637  sensor protein BasS/PmrB  25.28 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4546  sensor protein BasS/PmrB  25.66 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4553  sensor protein BasS/PmrB  25.28 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  26.72 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  26.72 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.64 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  26.32 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  23.53 
 
 		 597 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  25.3 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  21.81 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  24.8 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 		 453 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  26.18 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 563 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3444  histidine kinase  21.7 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.35 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0594  sensor histidine kinase/response regulator  28.79 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  26.35 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  23.85 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  25.28 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  26.8 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  27.13 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  25.71 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  26.72 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1954  sensor histidine kinase  26.23 
 
 		 451 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2265  two-component sensor protein  24.32 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000076955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  26.07 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  24.03 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  24.34 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1291  sensor histidine kinase  25.09 
 
 		 468 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  27.13 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  27.13 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  25.93 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  24.56 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  24.41 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  26.1 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4744  sensor histidine kinase  27.86 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4582  sensor histidine kinase  27.86 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.24147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  26.62 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.3 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5105  sensor histidine kinase  27.86 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1750  histidine kinase  31.34 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  25 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>