More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1758 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1758  histidine kinase  100 
 
 		 424 aa  866    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1385  histidine kinase HAMP region domain protein  35.61 
 
 		 411 aa  266  4e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543879  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0762  sensor histidine kinase  36.3 
 
 		 410 aa  266  5e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00585003  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1062  sensor histidine kinase  34.81 
 
 		 413 aa  259  8e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0111491  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0810  sensor histidine kinase  35.73 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00160023  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0979  sensor histidine kinase  35.41 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0781  two-component sensor histidine kinase  32.71 
 
 		 414 aa  223  4e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1361  sensor histidine kinase  33.96 
 
 		 415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1240  sensor histidine kinase  35.39 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000082564  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0499  sensor histidine kinase  35.39 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00768788  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0565  histidine kinase HAMP region domain protein  30.97 
 
 		 415 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1136  two-component sensor  37.23 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2095  histidine kinase A domain protein  33.58 
 
 		 412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 405 aa  163  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00345482  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1146  two-component sensor  33.58 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1359  HAMP domain-containing protein  29.34 
 
 		 420 aa  159  7e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0196913  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1398  sensor histidine kinase  32.26 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1278  sensor histidine kinase  32.15 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00689903  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0967  proline permease  31.55 
 
 		 418 aa  157  3e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.180674  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0463  sensor histidine kinase  31.21 
 
 		 388 aa  155  9e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000241496  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0495  two-component sensor histidine kinase  38.01 
 
 		 410 aa  149  8e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2130  histidine kinase HAMP region domain protein  33.57 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0451  putative putative two-component sensor  33.21 
 
 		 405 aa  130  6e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  23.2 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.45 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  22.8 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.96 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.18 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8577  histidine kinase  20.9 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558489  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2355  sensor histidine kinase  27.42 
 
 		 482 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  22.82 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  21.38 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  25.1 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  24.92 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  22.1 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.03 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  24.91 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.47 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  20.77 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  23.08 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.36 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.96 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  22.57 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  24.64 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  24.73 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  23.31 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1291  sensor histidine kinase  24.67 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  23.29 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  24.91 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0327  histidine kinase  24.62 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  24.31 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1012  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  23.29 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  21.14 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  20.18 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  22.42 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  24.18 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1750  histidine kinase  25.08 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.49 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.879307  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.52 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.51 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  24.83 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  22.69 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0785  sensor histidine kinase  23.63 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.190623  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4962  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0558  sensor histidine kinase  23.63 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5393  two-component signal transduction histidine kinase  22.67 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2073  sensor histidine kinase  23.63 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1623  sensor histidine kinase  23.63 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.51 
 
 		 563 aa  63.5  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0670  sensor histidine kinase  23.63 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539179  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1771  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.35 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  19.49 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.63 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  24.74 
 
 		 464 aa  63.2  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.71 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  23.2 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1570  sensor protein RstB  23.42 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  0.0828626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  19.76 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  24.59 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2957  sensor histidine kinase  25.57 
 
 		 506 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.882031  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.48 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0505996  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  25.16 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  25.16 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0489  sensor histidine kinase  23.55 
 
 		 722 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620999  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2570  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 515 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.283678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  23.84 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  24.71 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1921  histidine kinase  19.71 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000693193  hitchhiker  0.00000000000506219 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1976  sensor histidine kinase  23.69 
 
 		 453 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  21.91 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3170  sensor histidine kinase  24.16 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0904  sensor histidine kinase  23.55 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>