More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8577 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8577  histidine kinase  100 
 
 		 415 aa  795    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558489  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  82.65 
 
 		 414 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.879307  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  52.33 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.16 
 
 		 426 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  53.16 
 
 		 408 aa  249  6e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.48 
 
 		 427 aa  244  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  43.52 
 
 		 431 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0327  histidine kinase  51.31 
 
 		 408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 410 aa  230  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.31 
 
 		 431 aa  230  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.66 
 
 		 413 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.76 
 
 		 414 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2642  putative two component sensor histidine kinase protein  45.65 
 
 		 496 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0207  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.94 
 
 		 440 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  43.24 
 
 		 469 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  30.15 
 
 		 433 aa  143  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 453 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  30.15 
 
 		 433 aa  143  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  30.15 
 
 		 433 aa  143  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  29.85 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1795  sensor protein RstB  29.85 
 
 		 433 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0023579  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01578  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  30.58 
 
 		 433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0585044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  33.44 
 
 		 428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1684  sensor protein RstB  30.58 
 
 		 433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457824  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2021  sensor protein RstB  30.58 
 
 		 433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01568  hypothetical protein  30.58 
 
 		 433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0704541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 428 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 563 aa  138  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  31.82 
 
 		 428 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3107  histidine kinase  35.89 
 
 		 428 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1840  sensor protein RstB  32.99 
 
 		 432 aa  136  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0557058 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1570  sensor protein RstB  34.43 
 
 		 433 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  0.0828626 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 427 aa  135  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143276 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1703  sensor protein RstB  34.07 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181104  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  normal  0.345558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1639  sensor protein RstB  34.43 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449501  normal  0.84146 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1580  sensor protein RstB  34.43 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  0.442453 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1872  sensor protein RstB  34.07 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  35.02 
 
 		 538 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3001  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  35.79 
 
 		 452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4890  histidine kinase  35.78 
 
 		 465 aa  133  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1673  sensor histidine kinase  34.07 
 
 		 464 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2324  histidine kinase  32.32 
 
 		 561 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00982982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  33.11 
 
 		 536 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 459 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 421 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  37.09 
 
 		 476 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 602 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 420 aa  130  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  31.65 
 
 		 561 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  33.1 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  33.33 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.08 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  32.68 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2591  sensor protein RstB  35.19 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  36.33 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 461 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  27.03 
 
 		 446 aa  126  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1427  sensor protein RstB  30.68 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 536 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 420 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  31.46 
 
 		 456 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  33.71 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  29.15 
 
 		 449 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 		 490 aa  124  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3147  sensor histidine kinase  35.47 
 
 		 478 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0895878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 586 aa  123  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  33.98 
 
 		 453 aa  123  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0551  sensor protein RstB, putative  29.23 
 
 		 429 aa  123  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 454 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0877  histidine kinase  26.73 
 
 		 422 aa  123  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000773434  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 419 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  30.85 
 
 		 455 aa  123  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2353  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 428 aa  123  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.657028  normal  0.419056 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 429 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1001  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 422 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000619946  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1753  sensor protein RstB  32.23 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280951  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  30.41 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3288  histidine kinase  29.12 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000647105  normal  0.19017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1103  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000605909  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  28.12 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  34.7 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1070  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572613  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  34.7 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>