More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0150 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 414 aa  830    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0207  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  79.72 
 
 		 440 aa  610  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  62.84 
 
 		 398 aa  448  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  57.44 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  56.45 
 
 		 408 aa  403  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.48 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.14 
 
 		 413 aa  378  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.43 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0327  histidine kinase  54.24 
 
 		 408 aa  364  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  49.24 
 
 		 431 aa  266  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2642  putative two component sensor histidine kinase protein  50.88 
 
 		 496 aa  242  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8577  histidine kinase  48.76 
 
 		 415 aa  223  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558489  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.55 
 
 		 414 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.879307  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.58 
 
 		 410 aa  209  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 469 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  34.67 
 
 		 461 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 458 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 461 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 456 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 456 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1703  sensor protein RstB  29.22 
 
 		 436 aa  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  36.65 
 
 		 469 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3001  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 429 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  34.92 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 454 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1840  sensor protein RstB  29.06 
 
 		 432 aa  149  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0557058 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3107  histidine kinase  38.33 
 
 		 428 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  35.12 
 
 		 476 aa  149  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  34.44 
 
 		 428 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1872  sensor protein RstB  35.14 
 
 		 433 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00123019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1753  sensor protein RstB  34.32 
 
 		 435 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280951  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1639  sensor protein RstB  34.8 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449501  normal  0.84146 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1570  sensor protein RstB  34.8 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  0.0828626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1580  sensor protein RstB  34.8 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  0.442453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 563 aa  147  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2591  sensor protein RstB  34.71 
 
 		 434 aa  147  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 536 aa  146  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 430 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  33.44 
 
 		 433 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 459 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  33.23 
 
 		 452 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  33.44 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  33.44 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  34.01 
 
 		 442 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  34.01 
 
 		 442 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 442 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 442 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 442 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 442 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 459 aa  143  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  33.44 
 
 		 433 aa  143  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.49 
 
 		 467 aa  143  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 550 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  33.57 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1936  sensor protein RstB  34.78 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1825  sensor protein RstB  34.78 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 546 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 446 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 535 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1795  sensor protein RstB  33.11 
 
 		 433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0023579  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 420 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  normal  0.345558 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  30.97 
 
 		 455 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 428 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0877  histidine kinase  31 
 
 		 422 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000773434  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2276  sensor protein RstB  33.45 
 
 		 437 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  36.63 
 
 		 449 aa  138  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  34.48 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  34.14 
 
 		 538 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  30.68 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 449 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  36.18 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000439067  normal  0.678719 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01578  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with RstA  32.78 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0585044  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.64 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2021  sensor protein RstB  32.78 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 467 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01568  hypothetical protein  32.78 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0704541  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1684  sensor protein RstB  32.78 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457824  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 449 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2324  histidine kinase  32.57 
 
 		 561 aa  136  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00982982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2581  sensor protein RstB  32.33 
 
 		 437 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  30.94 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 494 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3595  sensor protein RstB, putative  31.02 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.198477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3185  ATPase domain-containing protein  31.88 
 
 		 422 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00240847  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.955625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  32.28 
 
 		 536 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  32.47 
 
 		 561 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 449 aa  133  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 454 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  30.32 
 
 		 386 aa  133  6.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>