More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0495 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0495  two-component sensor histidine kinase  100 
 
 		 410 aa  823    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1398  sensor histidine kinase  42.57 
 
 		 411 aa  345  1e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1278  sensor histidine kinase  43.04 
 
 		 391 aa  335  9e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00689903  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0463  sensor histidine kinase  43.12 
 
 		 388 aa  332  8e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000241496  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1136  two-component sensor  42.37 
 
 		 419 aa  331  1e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1146  two-component sensor  42.79 
 
 		 423 aa  326  4.0000000000000003e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1359  HAMP domain-containing protein  40.83 
 
 		 420 aa  316  4e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0196913  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0967  proline permease  41.26 
 
 		 418 aa  298  2e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.180674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0565  histidine kinase HAMP region domain protein  35.73 
 
 		 415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0781  two-component sensor histidine kinase  38.44 
 
 		 414 aa  219  6e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0762  sensor histidine kinase  40.29 
 
 		 410 aa  194  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00585003  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1361  sensor histidine kinase  37.42 
 
 		 415 aa  192  6e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1240  sensor histidine kinase  37.42 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000082564  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0499  sensor histidine kinase  37.12 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00768788  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1385  histidine kinase HAMP region domain protein  34.74 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543879  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0810  sensor histidine kinase  33.03 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00160023  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00345482  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1062  sensor histidine kinase  34.18 
 
 		 413 aa  180  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0111491  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2095  histidine kinase A domain protein  36.84 
 
 		 412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0979  sensor histidine kinase  32.02 
 
 		 412 aa  171  3e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1758  histidine kinase  36.43 
 
 		 424 aa  159  6e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2130  histidine kinase HAMP region domain protein  40.36 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0451  putative putative two-component sensor  29.67 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  22.96 
 
 		 458 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.91 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 471 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  21.89 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 465 aa  87.8  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1291  sensor histidine kinase  26.25 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  21.16 
 
 		 513 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.41 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  26.37 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  23.99 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  26.64 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.36 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 		 451 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 453 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0354974  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2353  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.657028  normal  0.419056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  21.11 
 
 		 526 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.11 
 
 		 531 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  20.14 
 
 		 524 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.479222  normal  0.0168851 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  26.07 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1012  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  26.7 
 
 		 438 aa  79.7  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  25.48 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  21.78 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  25.1 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.69 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  22.74 
 
 		 517 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.41 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 488 aa  77.4  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  26.1 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0845  histidine kinase  23.45 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000238884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3618  histidine kinase  29.21 
 
 		 472 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.7 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  25.34 
 
 		 449 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 484 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.237327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  22.44 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.6 
 
 		 1162 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  22.44 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3095  histidine kinase  23.53 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.56 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  25.39 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 484 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3882  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  23.66 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.96 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 463 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  22.74 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0747  histidine kinase  22.33 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.542154  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4860  histidine kinase  26.43 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  24.22 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  23.19 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.79 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6644  histidine kinase  21.45 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157131 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  24.83 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0070  sensor histidine kinase  26.43 
 
 		 480 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3178  sensory box histidine kinase VicK, putative  26.76 
 
 		 615 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111783  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.96 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3500  histidine kinase  24.38 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3689  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.142231  normal  0.016382 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  27.18 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  25.94 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5180  sensor protein vanSB  26.62 
 
 		 480 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>