More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1385 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1385  histidine kinase HAMP region domain protein  100 
 
 
411 aa  832    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543879  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0762  sensor histidine kinase  54.41 
 
 
410 aa  449  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00585003  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0810  sensor histidine kinase  51.82 
 
 
425 aa  422  1e-117  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00160023  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1062  sensor histidine kinase  50.85 
 
 
413 aa  413  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0111491  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0979  sensor histidine kinase  51.36 
 
 
412 aa  398  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0781  two-component sensor histidine kinase  48.91 
 
 
414 aa  384  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1361  sensor histidine kinase  45.52 
 
 
415 aa  330  4e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1240  sensor histidine kinase  44.33 
 
 
390 aa  300  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000082564  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0499  sensor histidine kinase  44.33 
 
 
390 aa  298  9e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00768788  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1758  histidine kinase  35.61 
 
 
424 aa  257  3e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0565  histidine kinase HAMP region domain protein  34.55 
 
 
415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1136  two-component sensor  34.88 
 
 
419 aa  216  7e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1359  HAMP domain-containing protein  34.31 
 
 
420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0196913  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1146  two-component sensor  38.34 
 
 
423 aa  196  9e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1398  sensor histidine kinase  32.02 
 
 
411 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2095  histidine kinase A domain protein  37.93 
 
 
412 aa  188  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1278  sensor histidine kinase  36.02 
 
 
391 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00689903  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0463  sensor histidine kinase  35.65 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000241496  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0967  proline permease  32.44 
 
 
418 aa  180  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.180674  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0495  two-component sensor histidine kinase  39.92 
 
 
410 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
405 aa  162  8.000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00345482  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2130  histidine kinase HAMP region domain protein  35.15 
 
 
418 aa  158  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0451  putative putative two-component sensor  30.26 
 
 
405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
471 aa  109  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 
445 aa  88.6  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  27.17 
 
 
458 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  25 
 
 
446 aa  87.4  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  24.11 
 
 
408 aa  86.7  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  24.73 
 
 
398 aa  86.3  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 
442 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 
426 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  27.74 
 
 
508 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.93 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.21 
 
 
438 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  28.17 
 
 
467 aa  84  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  26.12 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  25.09 
 
 
449 aa  82.8  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2387  histidine kinase  22.88 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.25 
 
 
488 aa  82.8  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.25 
 
 
488 aa  82.8  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  23.88 
 
 
429 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2285  sensor histidine kinase  25.97 
 
 
480 aa  82  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0585987  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  24.73 
 
 
449 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2058  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 
451 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.11 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.68 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.68 
 
 
438 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.51 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  22.68 
 
 
438 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  27.05 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
455 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.7 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  25.97 
 
 
449 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  23.84 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1833  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.13 
 
 
435 aa  80.1  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276388  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.61 
 
 
451 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 
449 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 
459 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.44 
 
 
455 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.68 
 
 
438 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  21.71 
 
 
425 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  23.71 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1750  histidine kinase  26.42 
 
 
454 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 
466 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 
449 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  21.04 
 
 
607 aa  78.2  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  27.24 
 
 
449 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  26.48 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.97 
 
 
535 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.68 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  26.48 
 
 
455 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  25.93 
 
 
458 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 
454 aa  77.8  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 
453 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 
449 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  27.61 
 
 
455 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  27.61 
 
 
455 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0203  signal transduction kinase protein  23.85 
 
 
439 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.573274  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
455 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  21.31 
 
 
480 aa  77  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  25 
 
 
456 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2528  histidine kinase  23.26 
 
 
475 aa  76.6  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00877701 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.3 
 
 
453 aa  76.6  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1836  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.46 
 
 
439 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542942  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1344  ATP-binding region ATPase domain protein  24.04 
 
 
452 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 
454 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7228  two component sensor kinase  21.66 
 
 
484 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  22.16 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  26.21 
 
 
458 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1771  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 
445 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0033  histidine kinase  23.62 
 
 
446 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00141174  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  25.87 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.97 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  hitchhiker  0.00000143015 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 
451 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.82 
 
 
438 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  23.58 
 
 
482 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 
458 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  22.61 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>