More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2130 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2130  histidine kinase HAMP region domain protein  100 
 
 		 418 aa  845    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0565  histidine kinase HAMP region domain protein  38.18 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1385  histidine kinase HAMP region domain protein  35.03 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543879  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0762  sensor histidine kinase  31.51 
 
 		 410 aa  166  6.9999999999999995e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00585003  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1136  two-component sensor  35.87 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2095  histidine kinase A domain protein  31.63 
 
 		 412 aa  159  9e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0495  two-component sensor histidine kinase  40.36 
 
 		 410 aa  158  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0781  two-component sensor histidine kinase  31.43 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1146  two-component sensor  34.91 
 
 		 423 aa  154  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1361  sensor histidine kinase  32.67 
 
 		 415 aa  154  4e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1240  sensor histidine kinase  32.67 
 
 		 390 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000082564  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1359  HAMP domain-containing protein  34.42 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0196913  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0810  sensor histidine kinase  32.28 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00160023  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0499  sensor histidine kinase  35.09 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00768788  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1758  histidine kinase  33.57 
 
 		 424 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0979  sensor histidine kinase  34.3 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1062  sensor histidine kinase  32.4 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0111491  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1398  sensor histidine kinase  28.94 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1278  sensor histidine kinase  33.09 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00689903  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0463  sensor histidine kinase  33.22 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000241496  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0967  proline permease  36.94 
 
 		 418 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.180674  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 405 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00345482  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0451  putative putative two-component sensor  29.1 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1750  histidine kinase  29.55 
 
 		 454 aa  96.3  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  26.15 
 
 		 491 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  25.46 
 
 		 507 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  27.31 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2528  histidine kinase  23.55 
 
 		 475 aa  82.8  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00877701 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  25.6 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2892  sensor histidine kinase SrrB, putative  27 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000807575  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  29.68 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.41 
 
 		 1162 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2355  sensor histidine kinase  27.4 
 
 		 482 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3061  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  30.18 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  27.51 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  25.26 
 
 		 538 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  27.18 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  26.83 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  26.83 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  25.97 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  25.55 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03690  histidine kinase  25.66 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.156811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  23.99 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0558  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.61 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3374  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  25 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  24.41 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1753  sensor protein RstB  25.84 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.280951  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  25 
 
 		 456 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  23.72 
 
 		 508 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.62 
 
 		 513 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  25 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4968  sensory box histidine kinase  24.92 
 
 		 609 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  24.41 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0924  sensor histidine kinase; MrsK2 protein  27.04 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115841  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.53 
 
 		 544 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  24.07 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0895  histidine kinase  26.47 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0538379  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  24.41 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0907  sensor histidine kinase  27.04 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1789  sensor protein RstB  25.09 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  24.41 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  24.16 
 
 		 461 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.542154  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0303  sensory box histidine kinase  24.58 
 
 		 616 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4936  sensory box histidine kinase  24.16 
 
 		 617 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  26.78 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.36 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1730  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  25 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3689  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.142231  normal  0.016382 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3500  histidine kinase  25 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  25.34 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  24.41 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  23.49 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  23.91 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4563  sensor histidine kinase  24.16 
 
 		 617 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  26.92 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  23.49 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 455 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  24.75 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  24.24 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  25.38 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3095  histidine kinase  27.83 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  28.02 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>