More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0565 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0565  histidine kinase HAMP region domain protein  100 
 
 		 415 aa  844    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1359  HAMP domain-containing protein  47 
 
 		 420 aa  361  1e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0196913  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0967  proline permease  45.26 
 
 		 418 aa  332  8e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.180674  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1146  two-component sensor  41.85 
 
 		 423 aa  331  1e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1136  two-component sensor  41.63 
 
 		 419 aa  327  3e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1385  histidine kinase HAMP region domain protein  34.55 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543879  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1398  sensor histidine kinase  35.68 
 
 		 411 aa  239  5e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2095  histidine kinase A domain protein  34.13 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0463  sensor histidine kinase  36.5 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000241496  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0495  two-component sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 410 aa  236  6e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1278  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00689903  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0762  sensor histidine kinase  32.84 
 
 		 410 aa  219  7e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00585003  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1062  sensor histidine kinase  33.42 
 
 		 413 aa  216  7e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0111491  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0810  sensor histidine kinase  33.82 
 
 		 425 aa  213  7e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00160023  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0979  sensor histidine kinase  33.83 
 
 		 412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0781  two-component sensor histidine kinase  32.68 
 
 		 414 aa  196  7e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1361  sensor histidine kinase  34.47 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1240  sensor histidine kinase  39.67 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000082564  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0499  sensor histidine kinase  39.67 
 
 		 390 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00768788  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 405 aa  182  8.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00345482  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1758  histidine kinase  30.97 
 
 		 424 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2130  histidine kinase HAMP region domain protein  41.41 
 
 		 418 aa  169  7e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0451  putative putative two-component sensor  29.29 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  26.77 
 
 		 467 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 471 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  26.26 
 
 		 458 aa  87  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  23.66 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  27.34 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  26.97 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  26.62 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  26.62 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  26.62 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  26.62 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  26.62 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  26.62 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  26.62 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2355  sensor histidine kinase  25.89 
 
 		 482 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  24.73 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4580  sensor protein PfeS  27.09 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  25.53 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.29 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.45 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3178  sensory box histidine kinase VicK, putative  24.36 
 
 		 615 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111783  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.01 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.74 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.26 
 
 		 449 aa  79.7  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.479222  normal  0.0168851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  23.59 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 		 470 aa  79.7  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  24.33 
 
 		 363 aa  79.7  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0169  histidine kinase  24.91 
 
 		 465 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  23.3 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 536 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  22.63 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  26.79 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0578  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  26.79 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 		 480 aa  78.2  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  25.46 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0327  histidine kinase  24.63 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  23.59 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  24.81 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.76 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52240  two-component sensor  25.79 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.332832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0533  sensor protein PfeS  25 
 
 		 442 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  25.65 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3932  histidine kinase  24.74 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  24.73 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.45 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  26.14 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4686  sensor protein BasS/PmrB  25.09 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.91 
 
 		 1162 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4553  sensor protein BasS/PmrB  25.09 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4546  sensor protein BasS/PmrB  25.09 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  26.26 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4637  sensor protein BasS/PmrB  25.09 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4637  sensor protein BasS/PmrB  25.09 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  26.05 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  26.32 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3588  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.71 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  24.93 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  25.95 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001060  signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  27.55 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 498 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2876  putative sensor histidine kinase SrrB  28.1 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3963  two-component sensor PfeS  24.6 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>