More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1136 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1136  two-component sensor  100 
 
 		 419 aa  849    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1359  HAMP domain-containing protein  58.15 
 
 		 420 aa  496  1e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0196913  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0967  proline permease  56.9 
 
 		 418 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.180674  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1146  two-component sensor  54.61 
 
 		 423 aa  462  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0565  histidine kinase HAMP region domain protein  41.63 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0495  two-component sensor histidine kinase  42.65 
 
 		 410 aa  311  2e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1398  sensor histidine kinase  42.16 
 
 		 411 aa  309  6.999999999999999e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1278  sensor histidine kinase  42.35 
 
 		 391 aa  296  6e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00689903  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0463  sensor histidine kinase  42.53 
 
 		 388 aa  291  2e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000241496  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0781  two-component sensor histidine kinase  39.83 
 
 		 414 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0762  sensor histidine kinase  34.04 
 
 		 410 aa  216  5e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00585003  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1385  histidine kinase HAMP region domain protein  34.88 
 
 		 411 aa  216  7e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543879  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0499  sensor histidine kinase  38.86 
 
 		 390 aa  206  8e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00768788  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1240  sensor histidine kinase  38.57 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000082564  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1361  sensor histidine kinase  38.57 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0979  sensor histidine kinase  32.47 
 
 		 412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2095  histidine kinase A domain protein  32.95 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0810  sensor histidine kinase  31.49 
 
 		 425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00160023  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1062  sensor histidine kinase  29.98 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0111491  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00345482  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1758  histidine kinase  37.23 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2130  histidine kinase HAMP region domain protein  39.21 
 
 		 418 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0451  putative putative two-component sensor  32.72 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2528  histidine kinase  24.71 
 
 		 475 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00877701 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  26.61 
 
 		 467 aa  86.7  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.22 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.479222  normal  0.0168851 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 563 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  23.45 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4352  sensor protein BasS/PmrB  23.36 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4666  sensor protein BasS/PmrB  23.36 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5625  sensor protein BasS/PmrB  23.36 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3178  sensory box histidine kinase VicK, putative  27.46 
 
 		 615 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111783  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  27.2 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0256  sensor histidine kinase  28.62 
 
 		 615 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3880  histidine kinase  23.57 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4577  sensor protein BasS/PmrB  23.57 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.75 
 
 		 1162 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3915  sensor protein BasS/PmrB  23.57 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BasR  23.57 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03944  hypothetical protein  23.57 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 504 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  24.08 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1291  sensor histidine kinase  25.19 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.08 
 
 		 426 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4890  histidine kinase  24.52 
 
 		 465 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  24.08 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  25.42 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  27.17 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  27.17 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2811  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 829 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  25.42 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  23.51 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0209  sensor histidine kinase  23.51 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  25.36 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3095  histidine kinase  26.88 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1385  histidine kinase  27.73 
 
 		 603 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.643671  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  25.42 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4637  sensor protein BasS/PmrB  23.27 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  22.33 
 
 		 434 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4553  sensor protein BasS/PmrB  23.27 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4637  sensor protein BasS/PmrB  23.27 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576296  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2892  sensor histidine kinase SrrB, putative  27.91 
 
 		 458 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000807575  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4686  sensor protein BasS/PmrB  23.27 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  23.97 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 		 601 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  27.19 
 
 		 507 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.18 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3828  sensor histidine kinase  27.23 
 
 		 604 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000117767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  27.09 
 
 		 603 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4546  sensor protein BasS/PmrB  23.27 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  24.3 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  22.06 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2876  putative sensor histidine kinase SrrB  28.22 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3170  sensor histidine kinase  26.09 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1371  sensor histidine kinase  25.89 
 
 		 603 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1623  sensor histidine kinase  25.76 
 
 		 603 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1344  sensor histidine kinase  25.89 
 
 		 603 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1554  sensor histidine kinase  25.89 
 
 		 603 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192618 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1343  sensor histidine kinase  25.89 
 
 		 603 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.830761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  22.14 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1482  sensor histidine kinase  25.89 
 
 		 603 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.27 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2353  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.657028  normal  0.419056 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  26.91 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.45 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  23.86 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4077  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.09 
 
 		 494 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134335  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  25.1 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3147  sensor histidine kinase  27.6 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0895878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  26.49 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  25.44 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>