More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0141 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 405 aa  793    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00345482  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0781  two-component sensor histidine kinase  33.74 
 
 		 414 aa  187  4e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0565  histidine kinase HAMP region domain protein  29.95 
 
 		 415 aa  182  7e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1136  two-component sensor  34.56 
 
 		 419 aa  178  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2095  histidine kinase A domain protein  30.71 
 
 		 412 aa  176  7e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0979  sensor histidine kinase  40.55 
 
 		 412 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0762  sensor histidine kinase  31.22 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00585003  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1359  HAMP domain-containing protein  31.25 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0196913  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0810  sensor histidine kinase  35.92 
 
 		 425 aa  169  8e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00160023  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1062  sensor histidine kinase  31.48 
 
 		 413 aa  166  8e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0111491  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0967  proline permease  34.44 
 
 		 418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.180674  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1385  histidine kinase HAMP region domain protein  31.53 
 
 		 411 aa  162  8.000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543879  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1758  histidine kinase  32.02 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1146  two-component sensor  37.29 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0495  two-component sensor histidine kinase  35.5 
 
 		 410 aa  159  7e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0463  sensor histidine kinase  29.88 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000241496  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1361  sensor histidine kinase  29.38 
 
 		 415 aa  149  9e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1278  sensor histidine kinase  29.29 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00689903  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1398  sensor histidine kinase  29.29 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0499  sensor histidine kinase  31.23 
 
 		 390 aa  146  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00768788  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1240  sensor histidine kinase  31.46 
 
 		 390 aa  146  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000082564  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2130  histidine kinase HAMP region domain protein  33.33 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0451  putative putative two-component sensor  29.22 
 
 		 405 aa  113  6e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0354974  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  31.67 
 
 		 508 aa  99.8  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 427 aa  96.7  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000439067  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 471 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.27 
 
 		 1162 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1344  ATP-binding region ATPase domain protein  28.71 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3288  histidine kinase  27.3 
 
 		 422 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000647105  normal  0.19017 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.38 
 
 		 461 aa  90.5  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.38 
 
 		 461 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0091  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 413 aa  90.5  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70693  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2930  histidine kinase  24.8 
 
 		 468 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.38 
 
 		 461 aa  90.9  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 466 aa  89.7  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0877  histidine kinase  28.62 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000773434  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  25.66 
 
 		 465 aa  89.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1103  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 422 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000605909  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4890  histidine kinase  24.91 
 
 		 465 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2811  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 829 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1070  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572613  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 563 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000107691  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1001  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000619946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  25 
 
 		 460 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  28.87 
 
 		 463 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2801  sensor protein RstB, putative  24.57 
 
 		 420 aa  87  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 466 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  23.29 
 
 		 468 aa  86.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  24.16 
 
 		 516 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0169  histidine kinase  28.29 
 
 		 465 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  27.43 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2217  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2423  histidine kinase  29.19 
 
 		 490 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  25.08 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000233737  normal  0.0772482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  26.33 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  25.98 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  22.95 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  26.24 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  25.98 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 493 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 494 aa  83.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0467  histidine kinase  25.2 
 
 		 451 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.928659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.48 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  26.24 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  21.74 
 
 		 536 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3595  sensor protein RstB, putative  22.7 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  26.24 
 
 		 458 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0754  signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 357 aa  82.4  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  23.4 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  27.38 
 
 		 480 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.56 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  25.62 
 
 		 458 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3185  ATPase domain-containing protein  24.19 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00240847  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  29.08 
 
 		 537 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  26.49 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 584 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.99 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3977  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  26.67 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  24.61 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  27.63 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  27.52 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3535  sensor histidine kinase  23 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2744  histidine kinase  26.32 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 614 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  27.92 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 640 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  27.97 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>