More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2353 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2353  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 428 aa  838    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.657028  normal  0.419056 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 431 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2318  sensor histidine kinase  37.03 
 
 		 423 aa  232  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0208  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 471 aa  207  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0149972  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  35.67 
 
 		 440 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 440 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 440 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 440 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  33.63 
 
 		 445 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1332  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 453 aa  186  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152315  decreased coverage  0.000105816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 		 535 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1939  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6140  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0713487  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 468 aa  182  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5250  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00425719  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1963  histidine kinase  33.03 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.0478368 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1288  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.370991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2396  sensor histidine kinase RisS  33.19 
 
 		 445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2508  sensor histidine kinase RisS  33.19 
 
 		 445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1878  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 449 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0696296  normal  0.299765 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  35.54 
 
 		 425 aa  180  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  35.54 
 
 		 425 aa  180  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2308  putative oxidative stress resistance periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.61 
 
 		 449 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 453 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000108072  hitchhiker  0.00000487933 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2353  sensor histidine kinase RisS  32.96 
 
 		 445 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0151579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3324  sensor histidine kinase RisS  32.96 
 
 		 445 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000798172  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1981  sensor histidine kinase RisS  32.96 
 
 		 445 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0389833  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1486  sensor histidine kinase RisS  33.26 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0605821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1254  sensor histidine kinase RisS  33.26 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00703057  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  35.75 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  44.11 
 
 		 438 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 453 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000286797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 434 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 451 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  41.76 
 
 		 471 aa  177  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.7 
 
 		 444 aa  176  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 449 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101119  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  38.32 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  34.82 
 
 		 449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 443 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0993  two-component sensor  36.76 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  33.84 
 
 		 433 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  37.28 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 435 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  28.19 
 
 		 432 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 488 aa  170  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 		 454 aa  169  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  34.55 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  34.3 
 
 		 440 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 488 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 488 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  36.86 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  32.16 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  39.22 
 
 		 391 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 485 aa  167  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 469 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.25 
 
 		 453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  38.8 
 
 		 458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  34.41 
 
 		 436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  33.44 
 
 		 436 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 462 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  29.21 
 
 		 444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 441 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 462 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 494 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  34.08 
 
 		 438 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  33.23 
 
 		 438 aa  163  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 462 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  34.41 
 
 		 429 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  40.53 
 
 		 435 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 493 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  33.97 
 
 		 438 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  43.39 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  33.44 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  31.12 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 454 aa  161  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  33.97 
 
 		 438 aa  161  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  33.65 
 
 		 438 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 469 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 464 aa  160  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 469 aa  160  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 438 aa  160  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  34.08 
 
 		 438 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3325  sensor histidine kinase  39.39 
 
 		 358 aa  160  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.205515  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  27.8 
 
 		 430 aa  159  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 488 aa  159  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  34.18 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>