70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5374 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5374  conjugal transfer protein TrbC  100 
 
 		 118 aa  224  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5223  conjugal transfer protein TrbC  58.54 
 
 		 115 aa  94.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2350  Conjugal transfer protein TrbC  53.33 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1719  Conjugal transfer protein TrbC  55.22 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000440508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2347  Conjugal transfer protein TrbC  53.12 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3540  conjugal transfer protein TrbC  43.48 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0127042  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7441  putative conjugal transfer protein  48 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.86569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3828  conjugal transfer protein TrbC  48.28 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1012  Conjugal transfer protein TrbC  44.93 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.84905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2028  conjugal transfer protein TrbC  50 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3900  conjugal transfer protein TrbC  44.93 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2818  Conjugal transfer protein TrbC  45.45 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.611363 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2825  Conjugal transfer protein TrbC  40.62 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3365  conjugal transfer protein trbC  39.08 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  0.615312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2879  conjugal transfer protein TrbC  38.54 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0544772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3003  conjugal transfer protein TrbC  40.62 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7742  conjugal transfer protein TrbC precursor  49.3 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4196  conjugal transfer protein TrbC  41.76 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0807  conjugal transfer protein TrbC  43.33 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3087  Conjugal transfer protein TrbC  41.11 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2323  conjugal transfer protein TrbC  43.75 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.547163  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2613  conjugal transfer protein TrbC  47.89 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2005  conjugal transfer protein TrbC  45.71 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1501  conjugal transfer protein trbC  48.39 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3852  conjugal transfer protein TrbC  47.22 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0185203  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2484  conjugal transfer protein TrbC  45.59 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.309797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0748  conjugal transfer protein TrbC  37.5 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3542  conjugal transfer protein TrbC  43.02 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2351  conjugal transfer protein TrbC  50 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.611476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1193  conjugal transfer protein TrbC  43.02 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35710  P-type conjugative transfer protein TrbC  44.29 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.120945  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3195  conjugal transfer protein TrbC  39.58 
 
 		 110 aa  52  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3692  conjugal transfer protein TrbC  45.83 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1317  Conjugal transfer protein TrbC  48.28 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3705  conjugal transfer protein TrbC  48.28 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.500827  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3505  Conjugal transfer protein TrbC  48.28 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30930  TrbC-like protein  48.28 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124423  unclonable  1.6158999999999998e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1283  conjugal transfer protein TrbC  48.28 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1342  conjugal transfer protein TrbC  48.28 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0563468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1896  Conjugal transfer protein TrbC  48.28 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1551  conjugal transfer protein TrbC  48.28 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0727  conjugal transfer protein TrbC  48.28 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2698  conjugal transfer protein TrbC  48.28 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.11268  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2583  conjugal transfer TrbC transmembrane protein  46.77 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2646  Conjugal transfer protein TrbC  50 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0965  Conjugal transfer protein TrbC  50.91 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5483  Conjugal transfer protein TrbC  34.69 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2910  conjugal transfer protein TrbC  48.28 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0162  conjugal transfer protein TrbC  49.15 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3213  conjugal transfer protein TrbC  44.93 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00593257  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0698  conjugal transfer protein TrbC  41.86 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0437  conjugal transfer protein TrbC  47.37 
 
 		 127 aa  50.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0508  conjugal transfer protein TrbC  48.53 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102779  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1483  conjugal transfer protein TrbC  44.93 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.157132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0155  conjugal transfer protein TrbC  41.25 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0317  conjugal transfer protein TrbC  45.16 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185631  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2269  conjugal transfer protein TrbC  48.39 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0596  conjugal transfer protein TrbC  48.28 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1836  conjugal transfer protein TrbC  40.91 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3999  conjugal transfer protein TrbC  46.77 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.613451  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2501  conjugal transfer protein TrbC  35.9 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9268  conjugal transfer protein TrbC  47.83 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5377  conjugal transfer protein TrbC  36.59 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.224067 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4273  conjugal transfer protein TrbC  38.05 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000103754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2819  Conjugal transfer protein TrbC  35.78 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.611363 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0257  Type IV secretory pathway AvhB2 protein  35.11 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4691  conjugal transfer protein TrbC  27.08 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9659  conjugal transfer protein  52.78 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6634  conjugal transfer protein TrbC  41.1 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197528  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6503  conjugal transfer protein TrbC  41.1 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>