26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2819 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2819  Conjugal transfer protein TrbC  100 
 
 		 122 aa  244  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.611363 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2818  Conjugal transfer protein TrbC  37.98 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.611363 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1012  Conjugal transfer protein TrbC  49.15 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.84905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2028  conjugal transfer protein TrbC  42.86 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7441  putative conjugal transfer protein  47.06 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.86569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3900  conjugal transfer protein TrbC  47.37 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3540  conjugal transfer protein TrbC  47.37 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0127042  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3365  conjugal transfer protein trbC  45.61 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  0.615312 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2350  Conjugal transfer protein TrbC  40.54 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5377  conjugal transfer protein TrbC  32.35 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.224067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3828  conjugal transfer protein TrbC  48.15 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5483  Conjugal transfer protein TrbC  36.76 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0807  conjugal transfer protein TrbC  50.85 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2879  conjugal transfer protein TrbC  44.07 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0544772 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5374  conjugal transfer protein TrbC  35.78 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4273  conjugal transfer protein TrbC  35.29 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000103754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2269  conjugal transfer protein TrbC  49.09 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5223  conjugal transfer protein TrbC  40 
 
 		 115 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1836  conjugal transfer protein TrbC  50.91 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2347  Conjugal transfer protein TrbC  37.1 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1501  conjugal transfer protein trbC  43.86 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0965  Conjugal transfer protein TrbC  49.09 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0162  conjugal transfer protein TrbC  48.15 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2323  conjugal transfer protein TrbC  45.76 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.547163  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2825  Conjugal transfer protein TrbC  45.76 
 
 		 113 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7742  conjugal transfer protein TrbC precursor  47.46 
 
 		 119 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.429944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>