28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5223 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5223  conjugal transfer protein TrbC  100 
 
 		 115 aa  220  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5374  conjugal transfer protein TrbC  52.21 
 
 		 118 aa  102  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2350  Conjugal transfer protein TrbC  53.33 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1719  Conjugal transfer protein TrbC  44.16 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000440508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7441  putative conjugal transfer protein  46.05 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.86569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2347  Conjugal transfer protein TrbC  41.89 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1012  Conjugal transfer protein TrbC  41.89 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.84905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3540  conjugal transfer protein TrbC  36.17 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0127042  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2028  conjugal transfer protein TrbC  42.19 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2818  Conjugal transfer protein TrbC  36.28 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.611363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3365  conjugal transfer protein trbC  39.19 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  0.615312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3900  conjugal transfer protein TrbC  39.66 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4273  conjugal transfer protein TrbC  49.02 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000103754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4568  conjugal transfer protein TrbC  51.92 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5483  Conjugal transfer protein TrbC  46.03 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0807  conjugal transfer protein TrbC  43.24 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5377  conjugal transfer protein TrbC  45.16 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.224067 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2819  Conjugal transfer protein TrbC  36.96 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.611363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2879  conjugal transfer protein TrbC  38.67 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0544772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0162  conjugal transfer protein TrbC  46.55 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1501  conjugal transfer protein trbC  41.94 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3828  conjugal transfer protein TrbC  42.37 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2825  Conjugal transfer protein TrbC  38.96 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9268  conjugal transfer protein TrbC  43.55 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1836  conjugal transfer protein TrbC  37.93 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6634  conjugal transfer protein TrbC  46.51 
 
 		 154 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197528  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6503  conjugal transfer protein TrbC  46.51 
 
 		 154 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3003  conjugal transfer protein TrbC  39.77 
 
 		 110 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>