62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2347 on replicon NC_011061
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011061  Paes_2347  Conjugal transfer protein TrbC  100 
 
 		 100 aa  191  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1719  Conjugal transfer protein TrbC  75 
 
 		 98 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000440508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2350  Conjugal transfer protein TrbC  46.74 
 
 		 104 aa  90.9  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5374  conjugal transfer protein TrbC  47.13 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2028  conjugal transfer protein TrbC  51.52 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7441  putative conjugal transfer protein  46.75 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.86569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1012  Conjugal transfer protein TrbC  47.76 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.84905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5223  conjugal transfer protein TrbC  45.21 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0807  conjugal transfer protein TrbC  40.24 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3540  conjugal transfer protein TrbC  43.24 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0127042  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4196  conjugal transfer protein TrbC  46.75 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3900  conjugal transfer protein TrbC  43.28 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3365  conjugal transfer protein trbC  46.77 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  0.615312 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2005  conjugal transfer protein TrbC  44.87 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2825  Conjugal transfer protein TrbC  40.26 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2879  conjugal transfer protein TrbC  37.8 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0544772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3828  conjugal transfer protein TrbC  42.11 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1836  conjugal transfer protein TrbC  47.14 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3195  conjugal transfer protein TrbC  44.12 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0155  conjugal transfer protein TrbC  36.14 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2818  Conjugal transfer protein TrbC  34.38 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.611363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0748  conjugal transfer protein TrbC  42.25 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35710  P-type conjugative transfer protein TrbC  43.24 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.120945  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0698  conjugal transfer protein TrbC  38.55 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2323  conjugal transfer protein TrbC  42.65 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.547163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1501  conjugal transfer protein trbC  42.86 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1483  conjugal transfer protein TrbC  41.18 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.157132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7742  conjugal transfer protein TrbC precursor  47.06 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3852  conjugal transfer protein TrbC  43.66 
 
 		 125 aa  52.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0185203  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3999  conjugal transfer protein TrbC  45.31 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.613451  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3542  conjugal transfer protein TrbC  42.65 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1193  conjugal transfer protein TrbC  42.65 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1283  conjugal transfer protein TrbC  46.88 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3087  Conjugal transfer protein TrbC  40 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3003  conjugal transfer protein TrbC  39.44 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0508  conjugal transfer protein TrbC  42.65 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102779  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2501  conjugal transfer protein TrbC  39.13 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2583  conjugal transfer TrbC transmembrane protein  44.78 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3692  conjugal transfer protein TrbC  42.25 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2351  conjugal transfer protein TrbC  49.18 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.611476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3505  Conjugal transfer protein TrbC  48.39 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2646  Conjugal transfer protein TrbC  50 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3213  conjugal transfer protein TrbC  41.79 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00593257  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2698  conjugal transfer protein TrbC  48.39 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.11268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2910  conjugal transfer protein TrbC  48.39 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2613  conjugal transfer protein TrbC  41.18 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1317  Conjugal transfer protein TrbC  48.33 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30930  TrbC-like protein  47.54 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124423  unclonable  1.6158999999999998e-22 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0162  conjugal transfer protein TrbC  45.61 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0317  conjugal transfer protein TrbC  43.55 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185631  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3705  conjugal transfer protein TrbC  47.54 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.500827  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0965  Conjugal transfer protein TrbC  45.45 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1551  conjugal transfer protein TrbC  47.54 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1342  conjugal transfer protein TrbC  47.54 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0563468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2269  conjugal transfer protein TrbC  45.31 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0596  conjugal transfer protein TrbC  44.26 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2484  conjugal transfer protein TrbC  41.18 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.309797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0437  conjugal transfer protein TrbC  47.37 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1896  Conjugal transfer protein TrbC  47.37 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0727  conjugal transfer protein TrbC  47.37 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4691  conjugal transfer protein TrbC  31.71 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2819  Conjugal transfer protein TrbC  40 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.611363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>