21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4691 on replicon NC_010000
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010000  Sbal195_4691  conjugal transfer protein TrbC  100 
 
 		 106 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4273  conjugal transfer protein TrbC  36.63 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000103754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5483  Conjugal transfer protein TrbC  44.32 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6634  conjugal transfer protein TrbC  39.08 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197528  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6503  conjugal transfer protein TrbC  39.08 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2501  conjugal transfer protein TrbC  42.68 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5377  conjugal transfer protein TrbC  41.38 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.224067 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9268  conjugal transfer protein TrbC  38.14 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0048  conjugal transfer protein TrbC  37.5 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338701  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4568  conjugal transfer protein TrbC  39.13 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1619  Conjugal transfer protein TrbC  32 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8333  conjugal transfer protein TrbC  37.25 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.653427  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9659  conjugal transfer protein  40.58 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1719  Conjugal transfer protein TrbC  36.9 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000440508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2347  Conjugal transfer protein TrbC  35.82 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2818  Conjugal transfer protein TrbC  33.71 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.611363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2350  Conjugal transfer protein TrbC  33.73 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2266  conjugal transfer protein TrbC  33.75 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154059  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2028  conjugal transfer protein TrbC  40 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5374  conjugal transfer protein TrbC  27.08 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1012  Conjugal transfer protein TrbC  38.18 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.84905  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>