47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9659 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9659  conjugal transfer protein  100 
 
 		 121 aa  234  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5377  conjugal transfer protein TrbC  69.09 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.224067 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9268  conjugal transfer protein TrbC  69.72 
 
 		 134 aa  137  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5483  Conjugal transfer protein TrbC  69.16 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4568  conjugal transfer protein TrbC  64.52 
 
 		 123 aa  121  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8333  conjugal transfer protein TrbC  59.54 
 
 		 134 aa  120  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.653427  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4273  conjugal transfer protein TrbC  50 
 
 		 154 aa  90.5  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000103754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6503  conjugal transfer protein TrbC  50 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129568  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6634  conjugal transfer protein TrbC  50 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197528  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0048  conjugal transfer protein TrbC  37.36 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338701  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1619  Conjugal transfer protein TrbC  43.81 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4691  conjugal transfer protein TrbC  38.54 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5374  conjugal transfer protein TrbC  52.08 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2501  conjugal transfer protein TrbC  41.76 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2266  conjugal transfer protein TrbC  41.86 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154059  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1012  Conjugal transfer protein TrbC  41.25 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.84905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3540  conjugal transfer protein TrbC  46.97 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0127042  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3087  Conjugal transfer protein TrbC  43.75 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2323  conjugal transfer protein TrbC  46.25 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.547163  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3003  conjugal transfer protein TrbC  42.5 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2350  Conjugal transfer protein TrbC  37.89 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5088  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  44.34 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3828  conjugal transfer protein TrbC  49.09 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2825  Conjugal transfer protein TrbC  40.24 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2879  conjugal transfer protein TrbC  41.25 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0544772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7742  conjugal transfer protein TrbC precursor  47.3 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.429944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3900  conjugal transfer protein TrbC  45.61 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0748  conjugal transfer protein TrbC  43.42 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2028  conjugal transfer protein TrbC  42.62 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0698  conjugal transfer protein TrbC  43.9 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4179  VIRB2 type IV secretion  38.46 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5223  conjugal transfer protein TrbC  58.97 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2819  Conjugal transfer protein TrbC  39.33 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.611363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3365  conjugal transfer protein trbC  43.24 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  0.615312 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2818  Conjugal transfer protein TrbC  44.07 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.611363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3692  conjugal transfer protein TrbC  41.98 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3852  conjugal transfer protein TrbC  43.06 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0185203  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0807  conjugal transfer protein TrbC  37.5 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4196  conjugal transfer protein TrbC  41.25 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0257  Type IV secretory pathway AvhB2 protein  39.33 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4348  VIRB2 type IV secretion  41.57 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0162  conjugal transfer protein TrbC  46.43 
 
 		 104 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35710  P-type conjugative transfer protein TrbC  47.22 
 
 		 94 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.120945  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2613  conjugal transfer protein TrbC  41.33 
 
 		 114 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2484  conjugal transfer protein TrbC  44.29 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.309797 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2347  Conjugal transfer protein TrbC  38.46 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7441  putative conjugal transfer protein  39.24 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.86569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>