35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1619 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1619  Conjugal transfer protein TrbC  100 
 
 		 139 aa  271  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5483  Conjugal transfer protein TrbC  42.22 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5377  conjugal transfer protein TrbC  39.42 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.224067 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4273  conjugal transfer protein TrbC  41.67 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000103754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9268  conjugal transfer protein TrbC  40.23 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6503  conjugal transfer protein TrbC  43.84 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129568  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6634  conjugal transfer protein TrbC  43.84 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197528  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4691  conjugal transfer protein TrbC  32 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4568  conjugal transfer protein TrbC  43.27 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2501  conjugal transfer protein TrbC  42.27 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9659  conjugal transfer protein  42.86 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8333  conjugal transfer protein TrbC  45.33 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.653427  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2350  Conjugal transfer protein TrbC  32.14 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0048  conjugal transfer protein TrbC  32.47 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338701  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5374  conjugal transfer protein TrbC  37.04 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2028  conjugal transfer protein TrbC  37.93 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2347  Conjugal transfer protein TrbC  38.98 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2818  Conjugal transfer protein TrbC  42 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.611363 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1719  Conjugal transfer protein TrbC  36.36 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000440508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1012  Conjugal transfer protein TrbC  33.82 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.84905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7441  putative conjugal transfer protein  31.17 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.86569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1501  conjugal transfer protein trbC  32.5 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2825  Conjugal transfer protein TrbC  34.48 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0807  conjugal transfer protein TrbC  33.73 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3828  conjugal transfer protein TrbC  32.76 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.609661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0162  conjugal transfer protein TrbC  37.29 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3365  conjugal transfer protein trbC  33.33 
 
 		 109 aa  42  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  0.615312 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2484  conjugal transfer protein TrbC  35.21 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.309797 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5223  conjugal transfer protein TrbC  30.38 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3900  conjugal transfer protein TrbC  31.33 
 
 		 109 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3999  conjugal transfer protein TrbC  34.21 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.613451  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3540  conjugal transfer protein TrbC  32.76 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0127042  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2879  conjugal transfer protein TrbC  32.31 
 
 		 110 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0544772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0596  conjugal transfer protein TrbC  36.67 
 
 		 110 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3692  conjugal transfer protein TrbC  35.21 
 
 		 111 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>