23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0257 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0257  Type IV secretory pathway AvhB2 protein  100 
 
 		 98 aa  191  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5088  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  62.77 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4348  VIRB2 type IV secretion  64.95 
 
 		 99 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0675  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  58.82 
 
 		 99 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3821  VIRB2 type IV secretion  36.46 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.454971  normal  0.0306094 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3974  conjugal transfer protein TrbC  41.56 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3639  conjugal transfer protein TrbC  41.56 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.22412 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4179  VIRB2 type IV secretion  36.19 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4378  hypothetical protein  29.9 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5009  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  38.27 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0925105  normal  0.161179 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8226  type IV secretion system pilin subunit VirB2  38.36 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6161  type IV secretion system pilin subunit VirB2  36.9 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6407  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  37.36 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4564  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  33.7 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0169  hypothetical protein  29.41 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0770  type IV secretion system protein VirB2  32.91 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5374  conjugal transfer protein TrbC  35.11 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2350  Conjugal transfer protein TrbC  36.36 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0151  hypothetical protein  27.72 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9822  type IV secrection system pilin protein  38.71 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2501  conjugal transfer protein TrbC  46.67 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4447  conjugal transfer protein, trbC  37.35 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633969  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6204  Conjugal transfer protein TrbC  32.98 
 
 		 123 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.312703  normal  0.025016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>