14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4179 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4179  VIRB2 type IV secretion  100 
 
 		 111 aa  217  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6407  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  87.95 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9822  type IV secrection system pilin protein  88.41 
 
 		 116 aa  124  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4564  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  74.12 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4447  conjugal transfer protein, trbC  46.99 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633969  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5088  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  45.12 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0257  Type IV secretory pathway AvhB2 protein  36.19 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5009  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  37.18 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0925105  normal  0.161179 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4348  VIRB2 type IV secretion  45.24 
 
 		 99 aa  47.4  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5483  Conjugal transfer protein TrbC  41.67 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8226  type IV secretion system pilin subunit VirB2  42.65 
 
 		 121 aa  43.9  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9268  conjugal transfer protein TrbC  42.31 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6161  type IV secretion system pilin subunit VirB2  37.65 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5377  conjugal transfer protein TrbC  36.52 
 
 		 126 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.224067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>