19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_5088 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_5088  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  100 
 
 		 100 aa  191  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4348  VIRB2 type IV secretion  70 
 
 		 99 aa  120  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0257  Type IV secretory pathway AvhB2 protein  62.77 
 
 		 98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0675  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  59 
 
 		 99 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4179  VIRB2 type IV secretion  45.12 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5009  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  42.86 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0925105  normal  0.161179 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8226  type IV secretion system pilin subunit VirB2  44.12 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3821  VIRB2 type IV secretion  39.24 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.454971  normal  0.0306094 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3639  conjugal transfer protein TrbC  39.24 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.22412 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3974  conjugal transfer protein TrbC  39.24 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4378  hypothetical protein  31.52 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6161  type IV secretion system pilin subunit VirB2  39.24 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6407  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  37.74 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9268  conjugal transfer protein TrbC  38.38 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4447  conjugal transfer protein, trbC  42.86 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633969  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9822  type IV secrection system pilin protein  41.18 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4564  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  36.71 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5483  Conjugal transfer protein TrbC  37.89 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4568  conjugal transfer protein TrbC  44.21 
 
 		 123 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>