14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2266 on replicon NC_010579
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010579  XfasM23_2266  conjugal transfer protein TrbC  100 
 
 		 130 aa  256  9e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154059  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0048  conjugal transfer protein TrbC  71.05 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338701  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4273  conjugal transfer protein TrbC  52.07 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000103754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6503  conjugal transfer protein TrbC  60.23 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129568  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6634  conjugal transfer protein TrbC  60.23 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197528  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5483  Conjugal transfer protein TrbC  37.84 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5377  conjugal transfer protein TrbC  35.65 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.224067 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4568  conjugal transfer protein TrbC  40.21 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9268  conjugal transfer protein TrbC  37.62 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4691  conjugal transfer protein TrbC  33.75 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9659  conjugal transfer protein  35.24 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2501  conjugal transfer protein TrbC  36.11 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2350  Conjugal transfer protein TrbC  32.63 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8333  conjugal transfer protein TrbC  34.62 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.653427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>