More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3735 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3735  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 311 aa  618  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2960  LysR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5693  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7468  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3977  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal  0.0154243 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1258  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1729  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1815  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00510599  hitchhiker  0.000707933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26150  putative transcriptional regulator  39.07 
 
 		 308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0621134  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5916  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.746301 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6674  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 296 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143364 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6198  LysR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0533844 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5831  LysR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5754  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 300 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5998  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 300 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4415  LysR family transcriptional regulator  42 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3431  transcriptional regulator, LysR family  41.7 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3744  transcriptional regulator, LysR family  36.81 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0102  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6525  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5641  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245303  hitchhiker  0.0021835 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5893  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6527  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226284 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5325  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.972364  normal  0.036575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00460  transcriptional regulator TrpI  38.64 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.347028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0157  trpBA operon transcriptional activator  36.55 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0698  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.587126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1736  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0084  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0099  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000782403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2927  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 308 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5673  LysR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6037  LysR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.264299 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2767  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0731  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0099  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0039  transcriptional regulator TrpI  39.59 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0073  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 303 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2229  putative transcriptional regulator  40.08 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0102  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0035  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.15 
 
 		 318 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2922  DNA-binding transcriptional activator GcvA  40.61 
 
 		 294 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.554203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3057  DNA-binding transcriptional activator GcvA  40.61 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4486  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.906105  normal  0.839188 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4417  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.58 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.838235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3473  LysR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0731  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.742738  normal  0.12881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2398  DNA-binding transcriptional activator GcvA  42.08 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3012  DNA-binding transcriptional activator GcvA  42.08 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4194  transcriptional regulator, LysR family  38.05 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0402435 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2171  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6790  DNA-binding transcriptional activator GcvA  39.12 
 
 		 305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668323  hitchhiker  0.00000431754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3007  DNA-binding transcriptional activator GcvA  40.41 
 
 		 294 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6358  DNA-binding transcriptional activator GcvA  39.59 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0906  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0010  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 301 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1845  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465511 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5256  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1048  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0983  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288934  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3156  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3031  DNA-binding transcriptional activator GcvA  41.31 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0785  LysR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2214  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3368  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0998  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3137  transcriptional regulator, LysR family  38.68 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2639  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 296 aa  152  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2113  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 296 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1175  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 299 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204143  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1086  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404999  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2422  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2285  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1461  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 310 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0489  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3270  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 318 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.321515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3779  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3962  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1981  LysR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 312 aa  148  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0253  DNA-binding transcriptional activator GcvA  39.6 
 
 		 293 aa  149  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208187  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0669  transcriptional regulator LysR family  39.45 
 
 		 299 aa  148  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1268  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2479  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102884  hitchhiker  0.0063597 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0348  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.425258 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2377  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120288  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2761  transcription regulator protein  36.49 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21868  normal  0.56038 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0530  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0248  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02110  trpBA operon transcriptional regulator, LysR family; TrpI  37.5 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625987  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1584  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2145  LysR substrate-binding  39.8 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0477  DNA-binding transcriptional activator GcvA  39.26 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0281  DNA-binding transcriptional activator GcvA  39.26 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0293  DNA-binding transcriptional activator GcvA  39.26 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5351  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06604  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001290  transcriptional regulator LysR family protein  36.21 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.913137  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0491  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.5 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3355  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.05325  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1019  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>