More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3197 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3197  ABC-3 protein  100 
 
 		 304 aa  588  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2477  hypothetical protein  63.67 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  40.48 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0688  cation ABC transporter, permease protein, putative  44.98 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5933  ABC heavy metal transporter, inner membrane subunit  45.35 
 
 		 260 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2650  ABC-3 protein  45.35 
 
 		 260 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2458  putative cation ABC transporter, permease protein  43.43 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1027  metal ABC transport system permease protein  43.43 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0864  putative cation ABC transporter, permease protein  43.43 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0072  putative cation ABC transporter, permease protein  43.43 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0868  putative cation ABC transporter, permease protein  43.43 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2518  ABC-3 protein  44.87 
 
 		 262 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0624  putative cation ABC transporter, permease protein  43.43 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1956  ABC-3 protein  44.24 
 
 		 264 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0326  cation ABC transporter, permease protein, putative  43.78 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2626  ABC-3 protein  44.98 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0695  ABC-3 protein  43.75 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1992  hypothetical protein  44.98 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2602  ABC-3 protein  44.98 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2088  ABC-3 protein  48.72 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0715  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, inner membrane subunit  44.07 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3251  ABC-3 protein  43.49 
 
 		 260 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0485  ABC-3 protein  43.91 
 
 		 263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336382  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5102  ABC-3 protein  40.23 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593949  normal  0.159747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4717  hypothetical protein  40.23 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4803  ABC-3 protein  40.23 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5318  ABC-3 protein  38.49 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1456  ABC-3 protein  39.68 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4921  ABC-3 protein  35.56 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2476  hypothetical protein  40.77 
 
 		 303 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35280  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  41.46 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.74517  normal  0.501768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0295  ABC-3 protein  37.19 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0749  Mn2+/Zn2+ ABC transporter permease  36.29 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.152299  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2639  ABC-3 protein  39.76 
 
 		 295 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.668793  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.33 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0609  ABC-3 protein  35.02 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.746124  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2374  ABC-3 protein  38.78 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192422 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0605  cation ABC transporter, permease protein, putative  35.23 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0984  ABC-3 protein  38.96 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0757  ABC-3 protein  35.23 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.422432  normal  0.510372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0354  ABC-3 protein  38.75 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2616  ABC-3 protein  34.96 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3198  ABC-3 protein  35.84 
 
 		 319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0525861 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0805  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  30.15 
 
 		 266 aa  109  7.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2366  ABC-3 protein  36.22 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1720  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.6 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.798083 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2615  ABC-3 protein  37.91 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0294  ABC-3 protein  33.95 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0218  ABC-3 protein  31.23 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000173393  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1609  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  31.54 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0237  ABC-3 protein  37.54 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468194 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2089  ABC-3 protein  35.34 
 
 		 287 aa  92.8  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0756  ABC-3 protein  32.72 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.929566  normal  0.294702 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0604  cation ABC transporter, permease protein, putative  32.72 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  27.85 
 
 		 280 aa  91.7  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  29.07 
 
 		 269 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  29.07 
 
 		 269 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.47 
 
 		 285 aa  89.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  27.41 
 
 		 270 aa  89  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  28.47 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  31.27 
 
 		 304 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  25.21 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  27.41 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  25.83 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  24.58 
 
 		 272 aa  86.3  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  26.67 
 
 		 276 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28.04 
 
 		 270 aa  85.9  7e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2210  cation ABC transporter, permease protein  32.29 
 
 		 273 aa  85.5  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  31.07 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  30.28 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  27.66 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  30.22 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  30.15 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  31.03 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  24.52 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  28.62 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  31.53 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  30.61 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  27.54 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  27.54 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  27.01 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  29.55 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  27.62 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  37.13 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  29.03 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  24.91 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  30.17 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  28.67 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4178  ABC-3 protein  29.26 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162455  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  29.2 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  29.92 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  29.92 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  23.87 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  26.64 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  31.12 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1124  zinc ABC transporter, permease protein  30.2 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.750494  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  28.11 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3593  ABC-3 protein  34.48 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.234025 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  29.67 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0057  zinc transport system permease protein  29.92 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>