More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3198 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3198  ABC-3 protein  100 
 
 		 319 aa  609  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0525861 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2476  hypothetical protein  63.32 
 
 		 303 aa  272  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2089  ABC-3 protein  47.06 
 
 		 287 aa  172  9e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  38.01 
 
 		 293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0688  cation ABC transporter, permease protein, putative  39.86 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1456  ABC-3 protein  40.64 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0864  putative cation ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 		 274 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1027  metal ABC transport system permease protein  39.78 
 
 		 274 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2458  putative cation ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 		 274 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0868  putative cation ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 		 274 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0072  putative cation ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 		 274 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0624  putative cation ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 		 274 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0326  cation ABC transporter, permease protein, putative  39.93 
 
 		 263 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1956  ABC-3 protein  39.78 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5318  ABC-3 protein  38.37 
 
 		 285 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0695  ABC-3 protein  40 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4717  hypothetical protein  38.64 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4803  ABC-3 protein  38.64 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2518  ABC-3 protein  39.11 
 
 		 262 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5102  ABC-3 protein  38.26 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593949  normal  0.159747 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2626  ABC-3 protein  39.03 
 
 		 260 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2650  ABC-3 protein  39.63 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5933  ABC heavy metal transporter, inner membrane subunit  39.26 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0749  Mn2+/Zn2+ ABC transporter permease  34.77 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.152299  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1992  hypothetical protein  38.29 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2602  ABC-3 protein  38.29 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3197  ABC-3 protein  36.03 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3251  ABC-3 protein  39.19 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0715  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, inner membrane subunit  38.83 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0485  ABC-3 protein  38.63 
 
 		 263 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336382  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.04 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2088  ABC-3 protein  35.25 
 
 		 278 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0984  ABC-3 protein  37.5 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2616  ABC-3 protein  35.47 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2477  hypothetical protein  40.08 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0609  ABC-3 protein  33.1 
 
 		 294 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.746124  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1609  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  32.18 
 
 		 263 aa  105  8e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.53 
 
 		 282 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2374  ABC-3 protein  35.08 
 
 		 291 aa  102  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.53 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.53 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.53 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.25 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  32.28 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4921  ABC-3 protein  35.27 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0805  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  28.41 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2639  ABC-3 protein  34.85 
 
 		 295 aa  95.9  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.668793  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  25.6 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0354  ABC-3 protein  38.25 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  25.6 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  25.6 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  30.24 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  30.43 
 
 		 269 aa  94.7  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  30.57 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  31.08 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0604  cation ABC transporter, permease protein, putative  32.91 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  27.71 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0756  ABC-3 protein  32.09 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.929566  normal  0.294702 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  27.71 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  27.35 
 
 		 288 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  27.71 
 
 		 288 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  32.03 
 
 		 285 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1657  ABC-3 metal transporter  30.77 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  hitchhiker  0.00082794 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  25.27 
 
 		 278 aa  92.4  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  25.27 
 
 		 278 aa  92.4  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35280  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  40.23 
 
 		 298 aa  92.4  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.74517  normal  0.501768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0295  ABC-3 protein  33.57 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  29.69 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1720  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.04 
 
 		 263 aa  92  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.798083 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  33.82 
 
 		 287 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  26.86 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  33.04 
 
 		 283 aa  89.7  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  34.4 
 
 		 273 aa  89.4  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  34.96 
 
 		 287 aa  89  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0605  cation ABC transporter, permease protein, putative  34.17 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0757  ABC-3 protein  34.17 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.422432  normal  0.510372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  28.38 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  28.38 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  32.11 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  28.69 
 
 		 286 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  30.25 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  30.88 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  30.42 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0294  ABC-3 protein  31.14 
 
 		 306 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  28.22 
 
 		 289 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  27.46 
 
 		 280 aa  85.9  9e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  29.3 
 
 		 269 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  29.3 
 
 		 269 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  29.49 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  29.07 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  28.57 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  30.95 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  25.36 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  34.86 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  29.22 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  26.02 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  29.71 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2615  ABC-3 protein  33.18 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  30.74 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  27.14 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>