More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1609 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1609  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  100 
 
 
263 aa  511  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  46.88 
 
 
265 aa  239  5e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1720  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  46.64 
 
 
263 aa  226  3e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.798083 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0218  ABC-3 protein  51.98 
 
 
265 aa  209  5e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000173393  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0805  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  43.85 
 
 
266 aa  205  6e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  39.54 
 
 
293 aa  159  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0326  cation ABC transporter, permease protein, putative  36.47 
 
 
263 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0868  putative cation ABC transporter, permease protein  36.47 
 
 
274 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0624  putative cation ABC transporter, permease protein  36.47 
 
 
274 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1027  metal ABC transport system permease protein  36.47 
 
 
274 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0864  putative cation ABC transporter, permease protein  36.47 
 
 
274 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2458  putative cation ABC transporter, permease protein  36.47 
 
 
274 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0072  putative cation ABC transporter, permease protein  36.47 
 
 
274 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0688  cation ABC transporter, permease protein, putative  36.09 
 
 
263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2518  ABC-3 protein  36.7 
 
 
262 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1992  hypothetical protein  35.58 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2602  ABC-3 protein  35.58 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2626  ABC-3 protein  35.21 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1456  ABC-3 protein  32.81 
 
 
291 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0695  ABC-3 protein  35.09 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5933  ABC heavy metal transporter, inner membrane subunit  34.98 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1956  ABC-3 protein  33.97 
 
 
264 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2650  ABC-3 protein  35.36 
 
 
260 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5102  ABC-3 protein  31.72 
 
 
288 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593949  normal  0.159747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5318  ABC-3 protein  31.52 
 
 
285 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4717  hypothetical protein  32.32 
 
 
288 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4803  ABC-3 protein  32.32 
 
 
288 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2616  ABC-3 protein  33.6 
 
 
272 aa  122  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0715  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, inner membrane subunit  37.65 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0749  Mn2+/Zn2+ ABC transporter permease  33.46 
 
 
277 aa  115  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.152299  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  29.66 
 
 
269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  29.66 
 
 
269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3251  ABC-3 protein  37.65 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.494903 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  29.23 
 
 
269 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  31.23 
 
 
284 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4921  ABC-3 protein  29.01 
 
 
298 aa  108  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  32.95 
 
 
269 aa  108  9.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  25.95 
 
 
266 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.55 
 
 
285 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  30.13 
 
 
264 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  27.94 
 
 
277 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0485  ABC-3 protein  36.29 
 
 
263 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336382  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  27.84 
 
 
264 aa  102  5e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  27.1 
 
 
264 aa  102  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0295  ABC-3 protein  33.08 
 
 
270 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  30.4 
 
 
277 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  26.27 
 
 
272 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  26.27 
 
 
272 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  28.94 
 
 
277 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  29.36 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2477  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3197  ABC-3 protein  31.54 
 
 
304 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  28.33 
 
 
277 aa  96.3  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0609  ABC-3 protein  28.41 
 
 
294 aa  96.3  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.746124  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  28.91 
 
 
276 aa  96.3  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  26.97 
 
 
269 aa  95.9  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  29.43 
 
 
271 aa  95.5  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  28.68 
 
 
277 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  28.68 
 
 
277 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2476  hypothetical protein  33.2 
 
 
303 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  28.68 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  26.44 
 
 
278 aa  92.8  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  26.44 
 
 
278 aa  92.8  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  26.23 
 
 
277 aa  92.4  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2374  ABC-3 protein  27.86 
 
 
291 aa  92  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192422 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  28.05 
 
 
277 aa  92  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  26.07 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  27.07 
 
 
273 aa  90.5  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  28.2 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  25.71 
 
 
267 aa  89.7  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  28.96 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  27.2 
 
 
276 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  29.39 
 
 
268 aa  89.4  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  27.35 
 
 
266 aa  89  7e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  28.46 
 
 
285 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  28.31 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  28.68 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  28.31 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  28.31 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  28.31 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  28.68 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  25.1 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  28.31 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  29.12 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2639  ABC-3 protein  27.83 
 
 
295 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.668793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3198  ABC-3 protein  32.18 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0525861 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  24.41 
 
 
272 aa  87  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  24.3 
 
 
274 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  30.92 
 
 
265 aa  87  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  27.71 
 
 
273 aa  87  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  26.97 
 
 
268 aa  86.3  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  28.75 
 
 
275 aa  85.9  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0027  ABC-3 protein  30.71 
 
 
275 aa  85.5  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  26.69 
 
 
290 aa  85.5  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  26.69 
 
 
290 aa  85.5  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  25.52 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  26.29 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  25.1 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  29.72 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1444  hypothetical protein  27.43 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00097924  normal  0.0494808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>